SRDP实验流程
一、实验仪器:
高速台式冷冻离心机、匀浆机、超声波粉碎仪、漩涡搅拌器、电泳装置、荧光检测系统
二、实验药品及试剂:
三羟甲基氨基甲烷(Tris-base):购自Biotech
三羟甲基氨基甲烷马来酸酯(Tris-maleate):购自ACROS ORGANICS 十二烷基硫酸钠(SDS):购自Decent Biotech 山梨糖醇(D-Sorbitol):购自Sigma
氨基己酸(6-Aminocaproic acid):购自Sigma
PMSF):购自Amresco 苯甲基磺酰氟(Phenylmethylsuulfonyl fluoride,
Dig):购自Sigma 毛地黄皂苷(Digitonin,
甘油(Glycerol)购自:Decent Biotech
丙烯酰胺(Acrylamide,Acry):购自Decent Biotech N,N亚甲基双丙烯酰胺(N,N-methylene-bisacrylamide,Bis):购自Sigma 甘氨酸(Glycine):购自Decent Biotech
脱氧胆酸钠(Sodium deoxycholate,DOC):购自Sigma
N,N,N,N-四甲基二乙胺(N,N,N,N-tetramethyl ethylenedia mine,TEMED):购自Decent Biotech
过硫酸铵(Ammonium persulfate,APS):购自SCR沪试
考马斯亮蓝R250(Coomassie brilliant blue R250)
无水乙醇、冰乙酸、丙酮、盐酸均由国内其他厂家生产。
三羟甲基氨基甲烷盐酸盐(Tris-HCl)由Tris-base与盐酸调配至所需浓度
三、实验步骤:
1.含水量的测算
将采集的样品解冻,混匀。以锡纸折叠成杯,称重G1,取约1g样品于锡纸杯中,称鲜重G2。将锡纸杯及样品放入烘箱,100?下烘烤24h以上,取出冷却至室温,称重G3。
含水量:[1-(G3-G1)/(G2-G1)]*100%
2.叶绿素蛋白复合物的提取
取约1g新鲜样品解冻,称重。加入5。00mL Buffer A(2mM Tris-maleate,0.1M D-Sorbitol,0.5mM 氨基己酸,1mM PMSF),于25mL小烧杯中计时匀浆(分别设定匀浆时间为20s、40s、60s)。将匀浆液转移至50mL离心管中离心,离心机设置:转速4400转,温度4?,时间20min。
离心出的上清液倒出,加入丙酮稀释至20mL,留待荧光法定量分析。
向离心得到的沉淀中加入2.00mL Buffer B(2mM Tris-maleate,20g/L Dig),计时进行超声波粉碎(分别设定超声时间为20s、40s、60s),之后将离心管置于漩涡搅拌器上搅拌40s。将混合液放入离心机中离心,离心机设置:转速4400转,温度4?,时间20min。将离心出的上清液在同样条件下再次离心。 向离心出的上清液中加入1.00mL Buffer C(60% 甘油,0.5M Tris-HCl[pH=6.8]),取120μL准备电泳分离,其余以丙酮稀释至25mL,再取其中1mL稀释20倍留待荧光法定量分析。
3.丙酮直接提取法提取叶绿素
取约1g新鲜样品解冻,称重。加入5.00mL丙酮,匀浆40s,离心,离心机设置:转速5000转,温度4?,时间10min。离心后上清液保留,沉淀中加入5.00mL丙酮,同样设置下再次离心,离心后上清液与上一步上清液混合,沉淀重复此步。将三次离心的上清液混合后,以丙酮稀释至25mL,再取500μL以丙酮稀释至20mL,留待荧光法定量分析。
4.电泳分离
使用聚丙烯酰胺凝胶电泳对样品提取液进行分离分析。
实验尝试两种电泳胶配方(如下
表
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)
胶1 胶2
堆积分离 堆积胶 分离胶 胶 胶
10.26%(10% 浓度 3.9%(3.8% Acry) 4% 10% Acry)
1.32m3.30m30%Acry:Bis(37.5:1) 1.30mL 3.42mL L L
2.52m0.5MTris-HCl,pH=6.8 7.5mL — — L
2.50m1.5MTris-HCl,pH=8.8 — 0.83mL — L 5%DOC — 1.00mL — —
6.00m4.05m高纯水 1.14mL 4.69mL L L TEMED 5μL 5μL 10μL 5μL 10%APS 50μL 50μL 50μL 50μL 总计 10mL 10mL 10mL 10mL
两种配方及相应缓冲液、实验条件参考不同厂家和
胶1采用的电泳缓冲液配方为:
0.3% Tris-base, 1.44% Glycine, 0.05% DOC
胶2采用的电泳缓冲液配方为
25mM Tris-base, 192 mM Glycine, 0.1% SDS
胶1采用电流控制,堆积胶20mA,分离胶40mA
胶2采用电压控制,堆积胶50V,分离胶200V
当蛋白前沿与胶板底距离约为1厘米时停止电泳,取出胶板。
撬开胶板,使用考马斯亮蓝染液(40% 无水乙醇,10% 冰醋酸,0.9%考马斯亮
蓝)染色。染色后使用脱色剂(40% 无水乙醇,7% 冰醋酸)脱色。拍照。