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引物设计,mir 颈环序列

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引物设计,mir 颈环序列
引物设计,mir 颈环序列 以hsa-miR-145为例设计引物,其成熟体序列为:GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCU 反向引物:每个反向引物的都带有一段固定的序列,可以形成一个茎环, 固定的序列为:5,-CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAG-3, 在这个序列后加上八个碱基,这八个碱基是hsa-miR-145从后面数八个碱基的反向互补序列,就是GAAUCCCU的反向互补:AGGGATTC,最后得到的反向引物的序列为 5,-CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAG AGGGATTC -3, 正向引物:每个正向引物也带有一段固定的序列,固定的序列为:ACACTCCAGCTGGG 来源:() - 学习microRNA的引物设计_wangchen922_新浪博客 在这个序列后加上于成熟体除后面六个外剩下的碱基序列,成熟体除掉后面六个碱基后序列为:GUCCAGUUUUCCCAGGA,把U变成T即可,最后的序列为: 5,-ACACTCCAGCTGGGGTCCAGTTTTCCCAGGA -3, URP:统一反向引物,也是一段固定的序列,TGGTGTCGTGGAGTCG U6引物F-CTCGCTTCGGCAGCACA ,R-AACGCTTCACGAATTTGCGT 使用方法: 1逆转的引物:所有要做的miRNA反向引物的混合,每个10微升 2PCR的引物:50微升的体系,30微升的水,10微升的正向引物,10微升的URP 12:CTGCCGGA AGCTTGATCGCCTC 13:CATGTCCG CGGGCCATTGAACG 14:CGGACATG GTTTGATCGGCGCATC 15:CATTGCCA ATGTACTGGACCATG 16:CACGCTCG ACTGGGCCGGTGGTGCG 17-5P:ATTCCGGG ACCCTGAGTGTCC 17-3P:TCTGAACC ACGGGTACACGTGGTGG 18:CACATATG TGTGACCAGTCGACA 19:TATCTGAG AGACGACACAGCCT 20:AACACGTG ATCCGCTGTGGCCA 21:TGGCATCC 22:CTTTGCCG CGCCGTGTGAGATCGTCG 23:ACGTCAGT GTTGTAGATGAGCGTAC 24:GGACTGTC TTGGCATCCATGTAGA U6-S CGCTTCGGCAGCACATATAC U6-R TTCACGAATTTGCGTGTCAT 以hsa-miR-145为例设计引物,其成熟体序列为:GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCU 反向引物:每个反向引物的都带有一段固定的序列,可以形成一个茎环, 固定的序列为:5,-CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAG-3, 在这个序列后加上八个碱基,这八个碱基是h情深深雨蒙蒙48全集sa-miR-145从后面数八个碱基的反向互补序列,就是GAAUCCCU的反向互补:AGGGATTC,最后得到的反向引物的序列为 5,-CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAG AGGGATTC -3, 正向引物:每个正向引物也带有一段固定的序列,固定的序列为:ACACTCCAGCTGGG 在这个序列后加上于成熟体除后面六个外剩下的碱基序列,成熟体除掉后面六个碱基后序列为:GUCCAGUUUUCCCAGGA,把U变成T即可,最后的序列为: 5,-ACACTCCAGCTGGGGTCCAGTTTTCCCAGGA -3, URP:统一反向引物,也是一段固定的序列,TGGTGTCGTGGAGTCG U6引物F-CTCGCTTCGGCAGCACA ,R-AACGCTTCACGAATTTGCGT 使用方法: 1逆转的引物:所有要做的miRNA反向引物的混合,每个10微升 2PCR的引物:50微升的体系,30微升的水,10微升的正向引物,10微升的URP;
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分类:医学
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