保护性碱基
切割率%
酶 寡核苷酸序列 链长
2 hr 20 hr GGTCGACC 8 0 0 Acc I
CGGTCGACCG 10 0 0 CCGGTCGACCGG 12 0 0
CACATGTG 8 0 0 Afl III
CCACATGTGG 10 >90 >90 CCCACATGTGGG 12 >90 >90 GGCGCGCC 8 >90 >90 Asc I
AGGCGCGCCT 10 >90 >90 TTGGCGCGCCAA 12 >90 >90 CCCCGGGG 8 50 >90 Ava I
CCCCCGGGGG 10 >90 >90 TCCCCCGGGGGA 12 >90 >90 CGGATCCG 8 10 25 BamH I
CGGGATCCCG 10 >90 >90 CGCGGATCCGCG 12 >90 >90
CAGATCTG 8 0 0 Bgl II
GAAGATCTTC 10 75 >90 GGAAGATCTTCC 12 25 >90 GGCGCGCC 8 0 0 BssH II
AGGCGCGCCT 10 0 0 TTGGCGCGCCAA 12 50 >90 GGGT(A/T)ACCC 9 0 10 BstE II
AACTGCAGAACCAATGCATTGG 22 0 0 BstX I
AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA 24 25 50
CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT 27 25 >90
CATCGATG 8 0 0 Cla I
GATCGATC 8 0 0 CCATCGATGG 10 >90 >90 CCCATCGATGGG 12 50 50
GGAATTCC 8 >90 >90 EcoR I
CGGAATTCCG 10 >90 >90 CCGGAATTCCGG 12 >90 >90 GGGGCCCC 8 >90 >90 Hae III
AGCGGCCGCT 10 >90 >90
TTGCGGCCGCAA 12 >90 >90
CAAGCTTG 8 0 0 Hind III
CCAAGCTTGG 10 0 0
CCCAAGCTTGGG 12 10 75
GGGTACCC 8 0 0 Kpn I
GGGGTACCCC 10 >90 >90
CGGGGTACCCCG 12 >90 >90
GACGCGTC 8 0 0 Mlu I
CGACGCGTCG 10 25 50
CCCATGGG 8 0 0 Nco I
CATGCCATGGCATG 14 50 75
CCATATGG 8 0 0 Nde I
CCCATATGGG 10 0 0
CGCCATATGGCG 12 0 0 GGGTTTCATATGAAACCC 18 0 0 GGAATTCCATATGGAATTCC 20 75 >90 GGGAATTCCATATGGAATTCCC 22 75 >90
GGCTAGCC 8 0 0 Nhe I
CGGCTAGCCG 10 10 25
CTAGCTAGCTAG 12 10 50
TTGCGGCCGCAA 12 0 0 Not I
ATTTGCGGCCGCTTTA 16 10 10 AAATATGCGGCCGCTATAAA 20 10 10 ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTAT 24 25 90
AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA 28 25 >90
TGCATGCATGCA 12 10 >90 Nsi I
CCAATGCATTGGTTCTGCAGTT 22 >90 >90
TTAATTAA 8 0 0 Pac I
GTTAATTAAC 10 0 25
CCTTAATTAAGG 12 0 >90
GTTTAAAC 8 0 0 Pme I
GGTTTAAACC 10 0 25
GGGTTTAAACCC 12 0 50
AGCTTTGTTTAAACGGCGCGCCGG 24 75 >90
GCTGCAGC 8 0 0 Pst I
TGCACTGCAGTGCA 14 10 10 AACTGCAGAACCAATGCATTGG 22 >90 >90
AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA 24 >90 >90
CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT 26 0 0
CCGATCGG 8 0 0 Pvu I
ATCGATCGAT 10 10 25
TCGCGATCGCGA 12 0 10
CGAGCTCG 8 10 10 Sac I
GCCGCGGC 8 0 0 Sac II
TCCCCGCGGGGA 12 50 >90
GTCGACGTCAAAAGGCCATAGCGGCCGC 28 0 0 Sal I
GCGTCGACGTCTTGGCCATAGCGGCCGCGG 30 10 50
ACGCGTCGACGTCGGCCATAGCGGCCGCGGAA 32 10 75
GAGTACTC 8 10 25 Sca I
AAAAGTACTTTT 12 75 75
CCCGGG 6 0 10 Sma I
CCCCGGGG 8 0 10
CCCCCGGGGG 10 10 50
TCCCCCGGGGGA 12 >90 >90
GACTAGTC 8 10 >90 Spe I
GGACTAGTCC 10 10 >90
CGGACTAGTCCG 12 0 50 CTAGACTAGTCTAG 14 0 50
GGCATGCC 8 0 0 Sph I
CATGCATGCATG 12 0 25 ACATGCATGCATGT 14 10 50
AAGGCCTT 8 >90 >90 Stu I
GAAGGCCTTC 10 >90 >90
AAAAGGCCTTTT 12 >90 >90
CTCTAGAG 8 0 0 Xba I
GCTCTAGAGC 10 >90 >90
TGCTCTAGAGCA 12 75 >90 CTAGTCTAGACTAG 14 75 >90
CCTCGAGG 8 0 0 Xho I
CCCTCGAGGG 10 10 25
CCGCTCGAGCGG 12 10 75
CCCCGGGG 8 0 0 Xma I
CCCCCGGGGG 10 25 75 CCCCCCGGGGGG 12 50 >90 TCCCCCCGGGGGGA 14 >90 >90
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