英文医学数据库检索

*英文医学数据库检索*问题的提出阿司匹林能否预防大肠癌？国内专业文献检索结果文献结论不一致很多国内文献摘译自国外专业文献**大纲一、英文数据库概述二、Pubmed文献检索系统*一、英文数据库概述按专业可分为：综合性数据库和专业数据库。综合性数据库：三大索引SCI科学引文索引ISTP科技会议录索引EI工程索引WebofScienceEngineeringVillages2*一、英文数据库概述专业数据库：医学领域常用四大索引SCI科学引文索引(WebofScience)BA生物学文摘(BIOSISPreview)CA化学文摘(CAPlus)WebofKnowledgeSciFinderScholarIM医学索引(Medline数据库）PubmedDialog联机检索系统*一、英文数据库概述英文数据库按记录完整性可分为文摘数据库和全文数据库。前面提到的英文专业数据库刚开始都是文摘数据库，但随着信息技术的发展都开始提供全文。新出现的数据库大都提供全文。全文数据库大都需要付费访问。即使是全文数据库，也不是库中的每篇论文都能提供全文。*一、英文数据库概述按收费与否，可分为收费数据库与免费数据库。英文数据库大部分收费。免费数据库：Pubmed：http://pubmed.govmedscape:http://www.medscape.comGoogleScholar:http://scholar.google.com*GoogleScholar查找国外专业文献检索提问式“colorectalcanceraspirin"时间限定在“2009年以来”获取结果16，900条结果*GoogleScholar查找国内专业文献记录来源包括ＣＮＫＩ、维普、万方以及其他网页信息*二、Pubmed文献检索系统知识精要（一）检索指南（二）*（一）、Pubmed知识精要沿革1资源2检索途径4常用字段3特色5*PubmedMedline光盘Medline联机检索IndexMedicus1997-1983-1964-1879-1.Pubmed沿革*Medline是美国国立医学图 书 关于书的成语关于读书的排比句社区图书漂流公约怎么写关于读书的小报汉书pdf 馆开发的生物医学文献数据库。可获取1950年以来80多个国家和地区5000多种生物医学期刊的文摘。1997年美国政府宣布Medline数据库免费向全世界开放。目前大多数收费的检索系统如WOK平台、Dialog检索系统、SciFinderScholar都可以检索Medline。*Medline免费检索服务Pubmed：http://pubmed.govMedscape：http://search.medscape.com/medline-searchHighwire：http://highwire.stanford.edu*利用Medscape检索Medline*2.Pubmed可获取资源Pubmed是美国国立医学图书馆（NLM）所属的国家生物技术信息中心（NationalCenterforBiotechnologyInformation，NCBI)开发的生物医学文献检索系统。是Entrez集成检索系统的重要组成部分。访问途径：公共网：http://pubmed.gov*2.Pubmed可获取资源（1）生物医学期刊论文线索MEDLINE：可获取1950年以来80多个国家的5000余种生物医学期刊中的文献线索。In-processcitations：待标引的MEDLINE的前期数据库。Publishersuppliedcitation：出版商提供的文献，主要是MEDLINE选择性收录的期刊中超出收录范围的文献。OLDMEDLINE:1965年以前的记录*（2）论文全文PubMedCentral开放存取期刊出版商提供的部分免费期刊链接到出版商网站（3）题录相关生物信息学数据、图书馆馆藏信息、消费者健康信息和研究工具等资源链接。*Pubmed记录来源标识（1）[PubMed–indexedforMedline][PubMed-inprocess][PubMed-assuppliedbypublisher]*Pubmed记录来源标识（2）免费全文*3.PubMed记录的主要字段(P85）字段标识：字段名称AB：AbstractAD：AffiliationALL：AllFieldAU：Authors1AU：FirstAuthorFAU：FullAuthorNamePMID：PubMedUniqueIdentifierDP：PublicationDate字段标识：字段名称LA：LanguageMH：MeSHTermsMAJR：MeSHMajorTopicSH：MeSHSubheadingsPT：PublicationTypeSO：SourceTA：JournalTitleTI：TitleTW：Text word word文档格式规范word作业纸小票打印word模板word简历模板免费word简历 s*4.PubMed检索途径高级检索基本检索*Pubmed高级检索限定字段进行检索利用索引选择提问词查看并利用已有检索式进行检索*PubmedMeshDatabase**MeSHDatabase:查看并利用主题词检索MeSH主题词检索是PubMed最具特色的检索功能之一，能保证较好的查全率和查准率主题词对同一概念的不同 表 关于同志近三年现实表现材料材料类招标技术评分表图表与交易pdf视力表打印pdf用图表说话 pdf 达方式进行了 规范 编程规范下载gsp规范下载钢格栅规范下载警徽规范下载建设厅规范下载 主题词组配副主题词，使检索结果更加专指主题词的树状结构表：可自由调整检索策略扩展检索：利用下位词同时进行检索，提高查全率限定检索：将检索结果限定在主要主题词，使检索结果更加准确注意：用MeSH词检索时，只检索来源于MEDLILNE的文献，不检索PubMed其他来源的文献*JournalsinNCBIDatabases查找期刊详细信息并获取期刊论文查找期刊详细信息并获取期刊论文*PubmedSingleCitationMatcher准确查找指定论文*5.Pubmed特色生物医学领域首选数据库收录期刊范围侧重生物医学领域检索免费，并可免费获取部分全文及相关生物信息学资源。文献报道速度快收录文献加工质量高，经Mesh主题词标引。检索功能强大，支持自动词语匹配检索，并提供主题词检索、临床查询、引文检索等特色检索服务。*　检索词Mesh转换表期刊名转换表作者索引表经过转换后的检索式Pubmed系统进行检索Details分析*作者姓名转换表PubMed特色：自动词语匹配功能*PubMed自动词语匹配功能举例：欲查找大肠癌与阿司匹林同时出现的文献，输入“colorectalcanceraspirin”，系统转换后实际检索策略为("colorectalneoplasms"[MeSHTerms]OR("colorectal"[AllFields]AND"neoplasms"[AllFields])OR"colorectalneoplasms"[AllFields]OR("colorectal"[AllFields]AND"cancer"[AllFields])OR"colorectalcancer"[AllFields])AND("aspirin"[MeSHTerms]OR"aspirin"[AllFields])*智能检索功能不仅能准确拆分词，而且能将提问词转换为MESH词，并在Mesh字段与全字段同时进行检索，有效保证文献的查全和查准。SearchDetails框详细显示自动词语匹配的实际检索式。*查看系统转换后的检索策略原始提问式系统转换过程系统实际检索策略*问题？Q：是否可以完全依赖词语的自动词语匹配功能？例如：单细胞Singlecell**自动词语匹配**如何避免系统进行自动词语匹配？检索词加上""（半角状态的双引号）,进行强制检索系统不进行自动词语匹配，不扩展检索singlecell直接输入"singlecell"或者single-cell***下列情形不进行自动词语匹配精确短语匹配,如“kidneyallograft”截词检索,如bacter*连字符时,如kidney-allograftHistory检索,如#1AND#２字段检索,如toothache[ti]*（二）、Pubmed检索指南如何查找阿司匹林预防大肠癌的文献？1如何查找指定文献？2*1.如何查找阿司匹林预防大肠癌的文献？课题分析两个主要概念组面阿司匹林（aspirin)大肠癌(colorectalcancer)如何翻译英文提问词？CNKI翻译助手Google翻译有道*1.如何查找阿司匹林预防大肠癌的文献？试检：Pubmed基本检索服务提问词：colorectalcanceraspirin*获取检索结果（上）限定条件进行检索，相当于原来的“Limits”功能自动获取相关文献转换显示 格式 pdf格式笔记格式下载页码格式下载公文格式下载简报格式下载 记录输出*获取检索结果（下）获取免费全文查找相关生物信息学数据库查看系统转换后的检索策略*转换记录显示格式AspirinforprophylacticuseintheprimarypreventionAspirinforprophylacticuseintheprimaryprevention*也可单击题名超链进入ABSTRACT格式作者单位来源查找刊名全称*NLMCatalog:获取刊名全称*将检索结果限定为近5年综述设置文献过滤器查找特定类型文献过滤条件一经选择持续起作用已选择的文件过滤器*♫利用主题词进行检索（难点）1.进入“MeshDatabase”界面2.在此界面查找“colorectalcancer(大肠癌)”对应的主题词(点击选定主题词超链，可获取主题词详细信息）3.输入提问框"Addtosearchbuilder"4.找到“aspirin”对应的主题词后，“Addtosearchbuilder”，逻辑运算符选择“And”5.“searchpubmed”进行检索6.在检索结果界面，点击选定文献题名超链，进行其文摘格式，在此界面下方点击“PublicationTypes,MeSHTerms,Substances”选项，获取主题词及主要主题词信息（注：主要主题词有“*”标志）*1.进入“MeshDatabase”界面两种方式进入MeshDatabase*2.查找主题词（上）定义及主题词引进年代c组配副主题词添加到检索框检索文献*2.查找主题词（下）c加权检索c相关参照扩展检索款目词：主题词同义词或近义词树状结构c上位词下位词*3.利用主题词进行检索添加到检索框检索文献(("ColorectalNeoplasms"[Mesh])OR"CecalNeoplasms"[Mesh])AND"Aspirin"[Mesh]*4.获取检索结果点击题名超链获取详细信息*5.获取记录详细信息*PublicationTypes,MeSHTerms,Substances：获取题录的文献类型、主题词及物质信息获取指定题录的主题词信息，其中带*号的为主要主题词*LinkOut：获取题录相关资源获取全文获取医学背景知识获取相关生物信息学数据*利用Linkout获取医学背景知识免费在线医学百科全书*课题2：如何查找英文原文？方法一：可以利用基本检索*如何查找中文摘译的英文原文？1.提取文中关键信息发表日期：2013年7月16日期刊名：AnnalsofInternalMedicine关键词：colorectalcancer,aspirin2.访问Pubmed，确定检索方法基本检索SingleCitationMatcher*(1)基本检索方式aspirincolorectalcancer"annalsofinternalmedicine"2013Q:为什么期刊名annalsofinternalmedicine要加双引号？*获取原文线索*在摘要页面点击“Linkout”*获取原文*(2)singlecitationmatcher检索*PubmedSingleCitationMatcherc检索提问式：Journal:annalsofinternalmedicineData:2013/07/16TitleWords:aspirin*annalsofinternalmedicine[Jour]and2013/07/16[pdat]andaspirin*Pubmed检索小结自动词语匹配检索一般适合检索经验有限的初级用户，也适合对课题做初步检索。检索经验丰富的用户，或者对查全率查准率有较高要求的检索课题，需要仔细分析课题，编制比较完备的检索策略，综合运用PubMed提供的各种高级检索功能不需要自动词语匹配功能时，可将词组加英文半角状态的双引号，要求系统进行精确短语匹配检索*Pubmed检索小结主题词检索PubMed最具特色的功能之一，能保证较好的查准率及查准率。主题词组配副主题词使检索结果更为专指，限定在主要主题词检索能使结果更准确。但是主题词检索也有一些固有的缺陷，比如很多专指的概念没有相应的主题词，一些新出现的概念要几年后才收录为主题词。这种情况下，采用字段限定检索等方法也能得到较好的查准率。主题词检索还可能会漏掉一些最新的文献（inprocesscitations）*