nullnull遗传评定概述
单性状育种值估计
多性状综合遗传评定Genetic Evaluation个体遗传评定null生产性能测定→遗传评定1432Generationnull获得优良后代畜禽遗传改良的
方法
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null育种工作的重要任务之一个体祖先同胞后裔育种值估计选 种Genetic Evaluation信息第二节 单性状育种值估计第二节 单性状育种值估计null
一、单项资料信息估计单性状育种值
二、多项资料信息估计单性状育种值育种值估计常用的资料信息来源育种值估计常用的资料信息来源育种值估计常用的资料信息来源资料信息来源:个体、祖先、同胞、后裔育种值估计常用的资料信息来源育种值估计常用的资料信息来源主要包括四个方面:
个体本身
记录
混凝土 养护记录下载土方回填监理旁站记录免费下载集备记录下载集备记录下载集备记录下载
祖先的记录
同胞的记录
后裔的记录个体性状表型值个体育种值(A)与各种资料来源(P)的关系个体育种值(A)与各种资料来源(P)的关系AAsAdP个体育种值与各种资料来源的关系个体育种值与各种资料来源的关系通径:表示变量间因果关系的线(单箭头)
通径线上的数值表明关系的程度
eg.1. As与A 之间有0.5的值,说明个体育种值的遗传基础有二分之一源自父亲个体育种值与各种资料来源的关系个体育种值与各种资料来源的关系eg.2. A与P间通径线上的h,表明每一个性状P中有一部分是由于A所致
其大小为该性状遗传力的平方根nullAAoP通过性能测定获得P
通过P估计APo一、单项资料估计单性状育种值一、单项资料估计单性状育种值(6-3) 建立育种值对表型值的回归方程:一、单项资料估计单性状育种值一、单项资料估计单性状育种值个体的估计育种值(EBV)个体育种值对信息表型值的回归系数用于育种值估计的信息表型值与该信息来源处于相同条件的群体均值(6-3)关键一、单项资料估计单性状育种值一、单项资料估计单性状育种值bAP的计算
公式
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(6-4):一、单项资料估计单性状育种值一、单项资料估计单性状育种值信息表型值剖分为
决定
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该表型值的育种值和剩余值:一般地,假设育种值与剩余值的协方差为0,即:一、单项资料估计单性状育种值一、单项资料估计单性状育种值提供信息的亲属个体与被估个体间的亲缘相关系数性状的加性遗传方差一、单项资料估计单性状育种值一、单项资料估计单性状育种值bAP的计算公式(6-4):个体育种值与信息表型值的协方差信息表型值方差一、单项资料估计单性状育种值一、单项资料估计单性状育种值1、个体本身单次度量表型值
2、个体本身多次度量均值
3、多个同类亲属单次度量均值
4、多个同类亲属多次度量均值
(作为多项资料来源处理)与信息资料形式有关。常用的信息资料形式有四种:信息来源度量次数一、单项资料估计单性状育种值一、单项资料估计单性状育种值个体本身的度量次数或同类亲属个体数性状单次度量的表型方差提供信息的同类个体间的亲缘系数(由P39公式2-14 得 )一、单项资料估计单性状育种值一、单项资料估计单性状育种值将上式代入6-4 ,可得:(6-5)null不同信息估计单性状育种值的bAP表1234null举例:一头母牛第一胎校正305天产奶量为6800kg,其所在牛群当年第一胎母牛平均校正305天产奶量为6400kg。已知产奶量的遗传力h2=0.25,求该母牛的估计育种值。
一、单项资料估计单性状育种值一、单项资料估计单性状育种值即:将bAP及信息表型值代入公式6-3,得到A
eg. 个体本身一次记录估计育种值育种值估准确度的衡量指标:估计育种值 与真实育种值 A 间的相关系数育种值估准确度的衡量指标:估计育种值 与真实育种值 A 间的相关系数(6-6)估计育种值的准确度取决于:被估个体与提供信息个体间的亲缘关系(rA)、性状的遗传力(h2)、可利用的信息数量(n)等一、单项资料估计单性状育种值不同信息来源估计育种值的特点不同信息来源估计育种值的特点一、个体本身信息
也称个体测定,利用个体本身信息估计育种值
包括单次度量值、多次度量值两种情况
单次度量值:加权系数即性状遗传力
一个群体内,个体育种值大小顺序与个体表型值大小一致不同信息来源估计育种值的特点不同信息来源估计育种值的特点一、个体本身信息
多次度量值:提高了育种值估计的准确度。消除部分特殊环境效应对个体的影响
bAP取决于度量次数k和性状重复力re: k越多,bAP相对越大; re越高,单次度量值的代表性越强,多次度量提高的效率变低最宜度量次数不同信息来源估计育种值的特点不同信息来源估计育种值的特点一、个体本身信息估计育种值特点
育种值估计准确度直接取决于性状遗传力大小
高遗传力性状通常采用个体测定
非限性性状应充分利用这一信息:eg.体重等不同信息来源估计育种值的特点不同信息来源估计育种值的特点二、系谱信息
也称系谱测定,包括父母及祖先的表型信息
主要利用父母的信息,然后是祖父母
更远的祖先提供信息价值有限,一般少用
单亲信息的bAP只有个体本身信息的一半,rA=0.5不同信息来源估计育种值的特点不同信息来源估计育种值的特点二、系谱信息
利用双亲一次度量均值估计育种值时, bAP等于遗传力
不同信息来源估计育种值的特点不同信息来源估计育种值的特点二、系谱信息估计育种值特点
早期选择:个体性状未表现之前
个体出生前,根据系谱记录的亲本成绩预测后代育种值
个体出生后,亲本信息作为个体选择的辅助信息,提高育种值估计的准确度不同信息来源估计育种值的特点不同信息来源估计育种值的特点三、同胞信息
亦称同胞测定,包括全同胞信息和半同胞信息
全同胞:同父同母的子女间,无近交情况时亲缘系数rA*为0.5。
半同胞:同父异母或同母异父的子女间,无近交情况时rA*为0.25。猪、鸡牛、羊不同信息来源估计育种值的特点不同信息来源估计育种值的特点三、同胞信息
bAP中分子和分母的亲缘系数含义不同
分子: rA 表示提供信息的个体与被估个体间的亲缘系数。全同胞为0.5,半同胞为0.25
分母: rA* 表示提供信息的个体间的亲缘系数。全同胞为0.5,半同胞为0.25
null1234不同信息估计单性状育种值的bAP表不同信息来源估计育种值的特点不同信息来源估计育种值的特点三、同胞信息估计育种值特点
同胞数目较多,可由此提高育种值估计的准确度
性状度量需屠宰后才能得到(如眼肌面积)
限性性状选择(产奶量)、阈性状选择(产犊数)
不同信息来源估计育种值的特点不同信息来源估计育种值的特点四、后裔信息
亦称后裔测定,包括半同胞子女和全同胞子女
育种值估计的目的:使后代获得最大的遗传进展
个体的后代性能是评价该个体种用价值高低的最可靠
标准
excel标准偏差excel标准偏差函数exl标准差函数国标检验抽样标准表免费下载红头文件格式标准下载
不同信息来源估计育种值的特点不同信息来源估计育种值的特点四、后裔信息
全同胞子女:同父同母的子女间,无近交情况时亲缘系数rA*为0.5
半同胞子女:同父异母的子女间,无近交情况时亲缘系数rA*为0.25
半同胞子女:bAP中分子、分母的亲缘系数不同null
1234不同信息估计单性状育种值的bAP表不同信息来源估计育种值的特点不同信息来源估计育种值的特点四、后裔信息估计育种值特点:
育种值估计准确度高
延长了世代间隔
主要针对影响较大且不能进行个体测定的种畜
奶牛种公牛的选择不同信息来源估计育种值的特点不同信息来源估计育种值的特点四、后裔信息
后裔测定注意事项:
保证一定的测定数量
消除与配母畜效应的影响:随机交配、统计学方法
控制后裔所处的环境:不同种公畜的比较,应在相同或尽可能相似的环境条件下饲养它们的女儿null小 结个体祖先同胞后裔育种值估计选 种Genetic Evaluation信息利用各种可利用的表型信息和特定的统计学方法,将加性遗传效应从表型值中剖分出来P = A+ R一、单项资料估计单性状育种值
举 例一、单项资料估计单性状育种值
举 例null表6-2 2头种公羊及其亲属的剪毛量(kg)记录(P151) (道良佐,1989)假设它们来自同一群体,该群体剪毛量均值为5.0kg,剪毛量的遗传力h2=0.2。根据不同信息估计2头种公羊剪毛量性状的育种值 一、单项资料估计单性状育种值举例一、单项资料估计单性状育种值举例1、根据个体本身记录
9-781号公羊的估计育种值和估计准确度分别是:一、单项资料估计单性状育种值举例一、单项资料估计单性状育种值举例2、根据半同胞兄妹记录
9-781号公羊:一、单项资料估计单性状育种值举例一、单项资料估计单性状育种值举例2、根据半同胞兄妹记录
9- 752号公羊:一、单项资料估计单性状育种值举例一、单项资料估计单性状育种值举例3、根据半同胞子女记录
9-781号公羊:一、单项资料估计单性状育种值举例一、单项资料估计单性状育种值举例3、根据半同胞子女记录
9-752号公羊:一、单项资料估计单性状育种值举例一、单项资料估计单性状育种值举例例6-1表明:
不同信息估计育种值的准确度不同:
子女(0.664)> 同胞(0.464)> 个体(0.447)>双亲均值(0.316)> 父亲或母亲(0.226)
单项信息估计育种值的准确度有限
提高选种准确度的措施:充分利用所有有关的信息进行育种值估计null作 业:
1、有如下信息资料,分别计算个体育种值估计的回归系数和准确度
1)个体本身5次表型记录,h2=0.25,r=0.6
2)500个半同胞的单次记录, h2=0.25
3)500个半同胞后裔的单次记录, h2=0.25
null
一、单项资料估计单性状育种值
二、多项资料估计单性状育种值复合育种值二、多项资料估计单性状育种值二、多项资料估计单性状育种值利用单项信息估计育种值的准确度有限
利用多项信息合并估计育种值的准确度较高本 身女 儿双 亲半同胞(盛志廉,陈耀生,1999)育种值估计常用的资料信息来源育种值估计常用的资料信息来源主要包括四个方面:
个体本身记录
祖先的记录
同胞的记录
后裔的记录多项信息资料多元回归null1、纯量(scalars):单个数值,通常用小写斜体字母表示。如 p=0.3、n=15 等
2、矩阵(matrix):由一组元素按一定顺序(行或列)构成。元素可以是纯量、数学表达式或矩阵。通常用大写粗体字母表示。如 A2 ×3
线性代数相关知识:回 忆null3、向量(vector):矩阵的一种,指包括一行(行向量)或一列(列向量)元素的矩阵线性代数相关知识:一般地,向量指列向量,用小写粗体字母表示
a为列向量、 a’为行向量
a’ a =纯量a’是a的转置矩阵null线性代数相关知识:4、矩阵的乘法计算两矩阵A、B可乘的条件:A的列数=B的行数null即:null线性代数相关知识:4、逆矩阵null二、多项资料估计单性状育种值null
复合育种值:同时利用多项亲属信息进行的育种值估计
二、多项资料估计单性状育种值多元线性回归b1 、 b2 …… bn null多项信息合并估计育种值的多元回归方程回归系数是计算关键
null计算回归系数的正规方程组:nullV:信息表型值间的方差-协方差矩阵
b:偏回归系数向量
c: 被估个体育种值与信息表型值间的协方差向量
r:被估个体与信息来源的亲缘系数向量(6-9)null正规方程组 对应于 :null复合育种值的计算步骤null二、多项资料估计单性状育种值举例例1:拟估计1号青年公牛的复合育种值
可供使用的信息资料记录:
母亲的产奶记录P1 =7020kg,对应的均值为6500kg
祖母的产奶记录P2 =8050kg,对应的均值为6450kg 有关的遗传参数已知:假设母亲和祖母来自同一群体,且无亲缘关系null据已知条件,有:二、多项资料估计单性状育种值举例解:先求矩阵V、c,以计算偏回归系数 :null根据 ,可得:null例2:设同群牛中2号青年公牛也参加遗传评定,此公牛可利用的资料是母亲及外祖母的记录母亲与外祖母的亲缘系数null二、多项资料估计单性状育种值举例则回归系数向量为:null二、多项资料估计单性状育种值假设2号青年公牛母亲和外祖母的产奶量表型值分别与1号公牛的母亲和祖母的成绩一致,则其复合育种值估计为:null二、多项资料估计单性状育种值2号公牛将1号公牛的祖母信息换成外祖母的信息(其它条件不变),结果使偏回归系数值变小,估计的育种值降低原 因?null二、多项资料估计单性状育种值 解 释:
2号公牛的信息资料间有亲缘关系(母亲与外祖母)
两资料为公牛提供的信息有一部分重复
总的信息量变小
1号公牛除母亲外,还有来自父亲的信息(祖母)
总的信息量大null复合育种值估计小结复合育种值的估计公式null复合育种值的计算步骤null复合育种值估计的准确度准确度的衡量指标:估计育种值与真实育种值间的相关系数b:偏回归系数向量
r:被估个体与信息来源的亲缘系数向量null复合育种值估计的准确度举例:以例1、例2中的1号、2号公牛作比较2号公牛估计育种值时,由于使用的信息有重复,导致估计的准确度降低null提高复合育种值估计准确度的方法:
使用尽可能多的信息资料
被估个体与信息来源个体的亲缘关系越近越好