实验一.核酸和蛋白质序列的使用一.实验目的：了解常用的序列数据库，掌握基本的序列数据信息的查询方法。二.实验基本要求：了解和熟悉NCBI核酸和蛋白质序列数据库，可以使用BLAST进行序列搜索，解读BLAST搜索结果，可以使用PHI-BLAST进行蛋白质序列的结构域搜索，解读蛋白质序列信息，可以在蛋白质三维数据库中查询相关结构信息并进行显示。三.实验内容提要：在序列数据库中查询某条基因序列（BRCA1），通过相关一系列数据库的搜索，比对与结果解释，回答以下问题：1.该基因的基本功能。2.编码的蛋白质序列是怎样的3.该蛋白质有没有保守的功能结构域。4.该蛋白质的功能是怎样的。5.该蛋白质的三级结构是怎样的，如果没有的话，和他最相似的同源物的结构是怎样的，给出示意图。四.实验结果：1.基因的基本信息：可见该基因的功能是编码一种核酸磷蛋白，该蛋白对维持基因稳定具有重要意义，也作为一种肿瘤抑制基因。2.蛋白质序列：mlkllnqkkgpsqcplcknditkrslqestrfsqlveellkiicafqldtgleyansynfakkennspehlkdevsiiqsmgyrnrakrllqsepenpslqetslsvqlsnlgtvrtlrtkqriqpqktsvyielgsdssedtvnkatycsvgdqellqitpqgtrdeisldsakkaacefsetdvtntehhqpsnndlnttekraaerhpekyqgssvsnlhvepcgtnthasslqhenssllltkdrmnvekaefcnkskqpglarsqhnrwagsketcndrrtpstekkvdlnadplcerkewnkqklpcsenprdtedvpwitlnssiqkvnewfsrsdellgsddshdgesesnakvadvldvlnevdeysgssekidllasdphealickservhsksvesniedkifgktyrkkaslpnlshvtenliigafvtepqiiqerpltnklkrkrrptsglhpedfikkadlavqktpeminqgtnqteqngqvmnitnsghenktkgdsiqneknpnpieslekesafktkaepisssisnmelelnihnskapkknrlrrksstrhihalelvvsrnlsppnctelqidscssseeikkkkynqmpvrhsrnlqlmegkepatgakksnkpneqtskrhdsdtfpelkltnapgsftkcsntselkefvnpslpreekeekletvkvsnnaedpkdlmlsgervlqtersvesssislvpgtdygtqesisllevstlgkaktepnkcvsqcaafenpkglihgcskdnrndtegfkyplghevnhsretsiemeeseldaqylqntfkvskrqsfapfsnpgnaeeecatfsahsgslkkqspkvtfeceqkeenqgknesnikpvqtvnitagfpvvgqkdkpvdnakcsikggsrfclssqfrgnetglitpnkhgllqnpyripplfpiksfvktkckknlleenfeehsmsperemgnenipstvstisrnnirenvfkeasssninevgsstnevgssineigssdeniqaelgrnrgpklnamlrlgvlqpevykqslpgsnckhpeikkqeyeevvqtvntdfspylisdnleqpmgsshasqvcsetpddllddgeikedtsfaendikessavfsksvqkgelsrspspfththlaqgyrrgakklesseenlssedeelpcfqhllfgkvnnipsqstrhstvateclsknteenllslknslndcsnqvilakasqehhlseetkcsaslfssqcseledltantntqdpfligsskqmrhqsesqgvglsdkelvsddeergtgleennqeeqsmdsnlgeaasgcesetsvsedcsglssqsdilttqqrdtmqhnliklqqemaeleavleqhgsqpsnsypsiisdssaledlrnpeqstsekavltsqksseypisqnpeglsadkfevsadsstsknkepgversspskcpslddrwymhscsgslqnrnypsqeelikvvdveeqqleesgphdltetsylprqdlegtpylesgislfsddpesdpsedrapesarvgnipsstsalkvpqlkvaesaqspaaahttdtagynameesvsrekpeltastervnkrmsmvvsgltpeefmlvykfarkhhitltnliteetthvvmktdaefvcertlkyflgiaggkwvvsyfwvtqsikerkmlnehdfevrgdvvngrnhqgpkraresqdrkifrgleiccygpftnmptdqlewmvqlcgasvvkelssftlgtgvhpivvvqpdawtedngfhaigqmceapvvtrewvldsvalyqcqeldtylipqiphshy3.发现该蛋白质有四段保守区域：共发现四段保守区域：BRCT interval 1603～1677 1716～1795 EIN3 interval 601～931 BRCT-assoc interval 297～460 4.该蛋白质的功能：窗体顶端breastcancertype1susceptibilityproteinisoform3五.蛋白质三级结构：
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