免疫共沉淀 原理

免疫共沉淀 原理 ?因为你IP的时候用的抗体～为了说明是你的抗体特异性的IP下来的东西～而不是其他抗体IP下来的～所以要用IgG作为对照。 当细胞在非变性条件下被裂解时～完整的细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质间结合的保持下来。这一事实可被用于检测和确定生理条件下相关的蛋白质-蛋白质之间的相互作用。这种 方法 快递客服问题件处理详细方法山木方法pdf计算方法pdf华与华方法下载八字理论方法下载 叫做免疫共沉淀 IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“prorein A"特异性地结合到免疫球蛋白的FC片段的现象活用开发出来的方法。目前多用精制的prorein A预先结合固化在argarose的beads上～使之与含有抗原的溶液及抗体反应后～beads上的prorein A就能吸附抗原达到精制的目的。 其优点为:,1,相互作用的蛋白质都是经翻译后修饰的～处于天然状态,,2,蛋白的相互作用是在自然状态下进行的～可以避免人为的影响,,3,可以分离得到天然状态的相互作用蛋白复合物。缺点为:,1,可能检测不到低亲和力和瞬间的蛋白质,蛋白质相互作用,,2,两种蛋白质的结合可能不是直接结合～而可能有第三者在中间起桥梁作用, ,3,必须在实验前预测目的蛋白是什么～以选择最后检测的抗体～所以～若预测不正确～实验就得不到结果～方法本身具有冒险性。 实验流程为: (1)转染后24-48 h 可收获细胞，加入适量细胞裂解缓冲液(含蛋白酶抑制剂)，冰上裂解30min, 细胞裂解液于4?C， 最大转速离心30 min后取上清; (2)取少量裂解液以备Western blot 分析 定性数据统计分析pdf销售业绩分析模板建筑结构震害分析销售进度分析表京东商城竞争战略分析 ，剩余裂解液加1μg相应的抗体加入到细胞裂解液，4?C缓慢摇晃孵育过夜; (3)取10μl protein A 琼脂糖珠，用适量裂解缓冲液洗3 次，每次3,000 rpm离心3 min; (4)将预处理过的10μl protein A 琼脂糖珠加入到和抗体孵育过夜的细胞裂解液中4?C缓慢摇晃孵育2-4h，使抗体与protein A琼脂糖珠偶连; (5)免疫沉淀反应后，在4?C 以3,000 rpm 速度离心3 min，将琼脂糖珠离心至管底;将上清小心吸去，琼脂糖珠用1ml裂解缓冲液洗3,4次;最后加入15μl的2×SDS 上样缓冲液，沸水煮5分钟; (6)SDS-PAGE, Western blotting或质谱仪分析。 注意的问 题 快递公司问题件快递公司问题件货款处理关于圆的周长面积重点题型关于解方程组的题及答案关于南海问题 : (1)细胞裂解采用温和的裂解条件，不能破坏细胞内存在的所有蛋白质,蛋白质相互作用，多采用非离子变性剂(NP40或Triton X-100)。每种细胞的裂解条件是不一样的，通过经验确定。不能用高浓度的变性剂(0.2,SDS)，细胞裂解液中要加各种酶抑制剂，如商品化的cocktailer。 (2)使用明确的抗体，可以将几种抗体共同使用 (3)使用对照抗体: 单克隆抗体:正常小鼠的IgG或另一类单抗 兔多克隆抗体:正常兔IgG 在免疫共沉淀实验中要保证实验结果的真实性，应注意以下几点: (1) 确保共沉淀的蛋白是由所加入的抗体沉淀得到的，而并非外源非特异蛋白，单克隆抗体的使用有助于避免污染的发生; (2) 要确保抗体的特异性，即在不 表 关于同志近三年现实表现材料材料类招标技术评分表图表与交易pdf视力表打印pdf用图表说话 pdf 达抗原的细胞溶解物中添加抗体后不会引起共沉淀; (3) 确定蛋白间的相互作用是发生在细胞中，而不是由于细胞的溶解才发生的，这需要进行蛋白质的定位来确定。 免疫共沉淀技术路线 准备工作: 预冷PBS，RIPA Buffer，细胞刮子(用保鲜膜包好后，埋冰下)，离心机 1. 用预冷的PBS洗涤细胞两次，最后一次吸干PBS; 7 2. 加入预冷的RIPA Buffer(1ml/10个细胞、10cm培养皿或150cm2培养 6瓶，0.5ml/5×10个细胞、6cm培养皿、75cm2培养瓶) 3. 用预冷的细胞刮子将细胞从培养皿或培养瓶上刮下，把悬液转到1.5EP 管中，4?，缓慢晃动15min(EP管插冰上，置水平摇床上) 4. 4?，14000g离心15min，立即将上清转移到一个新的离心管中 5. 准备Protein A agarose(琼脂糖珠)，用PBS 洗两遍珠子，然后用PBS配制成50%浓度，建议减掉枪尖部分，避免在涉及琼脂糖珠的操作中破坏琼脂糖珠 6. 每1ml总蛋白中加入100μl Protein A琼脂糖珠(50%)，4?摇晃10min(EP管插冰上，置水平摇床上)，以去除非特异性杂蛋白，降低背景 7. 4?，14000g离心15min，将上清转移到一个新的离心管中，去除Protein A珠子 8. (Bradford 法)做蛋白 标准 excel标准偏差excel标准偏差函数exl标准差函数国标检验抽样标准表免费下载红头文件格式标准下载 曲线，测定蛋白浓度，测前将总蛋白至少稀释1:10倍以上，以减少细胞裂解液中去垢剂的影响(定量，分装后，可以在-20?保存一个月) 9. 用PBS将总蛋白稀释到约1 μg/μl，以降低裂解液中去垢剂的浓度，如果兴趣蛋白在细胞中含量较低，则总蛋白浓度应该稍高(如10 μg/μl) 10. 加入一定体积的兔抗到500μl总蛋白中，抗体的稀释比例因兴趣蛋白在不同细胞系中的多少而异 11. 4?缓慢摇动抗原抗体混合物过夜或室温2h，激酶或磷酸酯酶活性分析建议用2 h室温孵育 12. 加入100μl Protein A琼脂糖珠来捕捉抗原抗体复合物，4?缓慢摇动抗原抗体混合物过夜或室温1h，如果所用抗体为鼠抗或鸡抗，建议加2 μl“过渡抗体”(兔抗鼠IgG，兔抗鸡IgG) 13. 14000rpm瞬时离心5s，收集琼脂糖珠-抗原抗体复合物，去上清，用预冷的RIPA buffer洗3遍，800μl/遍，RIPA buffer有时候会破坏琼脂糖珠-抗原抗体复合物内部的结合，可以使用PBS 14. 用60μl 2×上样缓冲液将琼脂糖珠-抗原抗体复合物悬起，轻轻混匀，缓冲液的量依据上样多少的需要而定(60 μl足够上三道) 15. 将上样样品煮5min，以游离抗原， 抗体，珠子，离心，将上清电泳，收集剩余琼脂糖珠，上清也可以暂时冻-20?，留待以后电泳，电泳前应再次煮5min变性。 RIPA Buffer配制: 基础成分: Tris-HCl(缓冲液成分，防止蛋白变性) NaCl(盐份，防止非特异蛋白聚集) NP-40(非离子去污剂，提取蛋白;用H2O配制成10%储存液) 去氧胆酸钠(离子去污剂，提取蛋白;用H2O配制成10%储存液;避光保存) 注意:准备激酶(致活酶)实验时，不要加去氧胆酸钠，因为离子型去污剂能够使酶变性，导致活性丧失。 RIPA蛋白酶抑制剂 苯甲基磺酰氟(PMSF)(用异丙醇配制成200mM的储存液，室温保存) EDTA(钙螯合剂;用H2O配制成100mM的储存液，PH 7.4) 亮抑酶肽(Leupeptin)(用H2O配制成1mg/ml的储存液，分装，-20?保存) 抑蛋白酶肽(Aprotinin)(用H2O配制成1mg/ml的储存液，分装，-20?保存) 胃蛋白酶抑制剂(Pepstatin)(用甲醇配制成1mg/ml的储存液，分装，-20?保存) RIPA磷酸(酯)酶抑制剂 激活的Na3VO4(用H2O配制成200mM的储存液，见Sodium Orthovanadate Activation Protoco) NaF(200mM的储存液，室温保存) 注意:在准备做磷酸(酯)酶实验的时候，不加磷酸酯酶抑制剂 工作液配制: 配制100ml的modified RIPA buffe: 1. 称取790mg 的Tris-Base，加到75ml 去离子水中，加入900mg的NaCl，搅拌，直到全部溶解，用HCl调节PH值到7.4 2. 加10 ml 10%的NP-40 3. 加2.5 ml 10%的去氧胆酸钠，搅拌，直到溶液澄清 4. 加1 ml 100mM的EDTA，用量筒定容到100ml，2-8?保存 5. 理论上，蛋白酶和磷酸酯酶抑制剂应该在使用当天同时加入(抑蛋白酶肽，亮抑酶肽,胃蛋白酶抑制剂各100 µl; PMSF, Na3VO4, NaF各500 µl)，但 是PMSF在水溶液中很不稳定，30分钟就会降解一半，所以PMSF应该在使用前现加，其他抑制剂成分可以在水溶液中稳定5天。 各种成分在工作液中的终浓度: • Tris-HCl: 50 mM, pH 7.4 • NP-40: 1% • 去氧胆酸钠:0.25% • NaCl: 150 mM • EDTA: 1 mM • PMSF: 1 mM • 抑蛋白酶肽，亮抑酶肽,胃蛋白酶抑制剂: 各1 µg/ml • Na3VO4: 1 mM • NaF: 1 mM 通过免疫共沉淀确定结合蛋白 1(用磷酸盐缓冲液洗30块10 cm培养板上的适宜细胞。刮去每块板上的细胞到1 ml冰冷的EBC裂解缓冲液中。 2(将每毫升细胞悬液转移到微量离心管中，在微量离心机上4?以最大速度离心15 min。 3(收集上清(约30 ml)并加入30μg的适当抗体，4?摇动免疫沉淀物1 h。 4(加入0.9 ml的蛋白质A-Sepharose 悬液，4?摇动免疫沉淀物30 min。 5(用含900 mmol/L NaCl的NETN洗蛋白A-Sepharose混合物，再重复洗5次。最后，用NETN洗一次。 6(吸出混合物的液体部分。加入800μl的1×SDS胶加样缓冲液到球珠中，煮沸4 min。 7(将样品加入到大孔的不连续SDS-PAGE梯度胶中，在10 mA的恒定电流下电泳过夜。 8(通过考马斯蓝染色观察蛋白质泳带。 9(从胶上切下目标带，将其放到微量离心管中，用1ml 50%乙腈洗两次，每次3 min。 10( 用胰蛋白酶消化胶中的蛋白质，再将肽电洗脱。 11( 通过窄孔高效液相色谱分离肽。将收集的肽在ABI 477A或494A机器上进行自动Edman降解测序。 免疫共沉淀原理及实验方法 一 原理 IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“protein A”特异性地结合到免疫球蛋白的FC片段的现象活用开发出来的方法。目前多用精制的protein A预先结合固化在argarose的beads上～使之与含有抗原的溶液及抗体反应后～beads上的protein A就能吸附抗原达到精制的目的。 实验最需要注意点就是抗体的性质。抗体不同和抗原结合能力也不同～免染能结合未必能用在IP反应。建议仔细检查抗体的说明书。特别是多抗的特异性是问题。 其次～要注意溶解抗原的缓冲液的性质。多数的抗原是细胞构成的蛋白～特别是骨架蛋白～缓冲液必须要使其溶解。为此～必须使用含有强界面活性剂的缓冲液～尽管它有可能影响一部分抗原抗体的结合。另一面～如用弱界面活性剂溶解细胞～就不能充分溶解细胞蛋白。即便溶解也产生与其它的蛋白结合的结果～抗原决定族被封闭～影响与抗体的结合～即使IP成功～也是很多蛋白与抗体共沉的悲惨结果。 再次～为防止蛋白的分解～修饰～溶解抗原的缓冲液必须加蛋白每抑制剂～低温下进行实验。 每次实验之前～首先考虑抗体/缓冲液的比例。抗体过少就不能检出抗原～过多则就不能沉降在beads上～残存在上清。缓冲剂太少则不能溶解抗原～过多则抗原被稀释。欲速则不达～确定好比例很必要 二 准备: 器械 微量高速冷冻离心机 移液枪 旋转盘 电泳设备 vortex震荡器 液氮及组织粉碎器 eppentube 试剂 细胞或组织 蛋白定量kit SDS电泳试剂 抗体(单抗时选择protein G,二抗选择抗鼠Ig兔血清) PBS NaN3 proteinA sapharose 试剂配制 抗原蛋白溶解缓冲液 1. RIPA缓冲液 (最终浓度) 1MTris-HCL(PH7.4) 5ml (10mM) 5MNacl 15ml (150mM) 0.5M EDTA(PH7.4) 5ml (5mM) 20%TritonX-100 25ml (1%) 10% DOC 50ml (1%) 10%SDS 5ml ( o.1%) TLCK 18.5mg (0.1mM) TPCK 35mg (0.2mM) DDW 395ml toal 500ml 另外～使用之前加1mMPMSF(PMSF溶在酒精～浓度100mM～-20度遮光保存。注意不易溶于水) 2. NP40 lysis 缓冲液 1MTris-HCL(PH7.4) 5ml (10mM) 5MNacl 15ml (150mM) 0.5M EDTA(PH7.4) 5ml (5mM) 20%NP40 25ml (1%) TLCK 18.5mg (0.1mM) TPCK 35mg (0.2mM) DDW 450ml toal 500ml 使用前加1mM的PMSF 注意点: *Tris缓冲剂PH随温度变化～高浓度盐酸滴定时发热～冷却后PH增高。 *反复使用PMSF要注意保管方法。 *1和2的缓冲剂的区别在于界面活性剂。TritonX-100,NP40是非离子界面活性剂～作用温和～～DOC