RNA噬菌体的基因组结构和功能
RNA噬菌体的基因组结构和功能
时间: 2008-08-16 10:32:38 | [<<] [>>]
目前研究最清楚的大肠杆菌RNA噬菌体是MS2，R17，f2和Qβ。它们的基因组小，只有3600到4200个核苷酸，包含四个基因。MS2.R17和f2具有几乎一样的基因组结构。在四个基因中两个基因编码噬菌体的结构蛋白:一个是A蛋白的基因，长1178个核苷酸。A蛋白(称为成熟蛋白)的功能是使噬菌体能识别宿主，并使其RNA基因组能进入宿主菌，每个噬菌体一般只在分子的A蛋白。另一个结构蛋白基因长399个核苷酸，编码外壳蛋白以构成病毒颗粒，每个噬菌体有180个分子。基因组的其他部分编码RNA复制酶和一个溶解蛋白，编码溶解蛋白的基因与外壳蛋白和复制酶的基因有部分重叠，但读框与外壳蛋白的读框不一样。在MS2、R17、f2基因组内有许多二级结构，RNA分子内碱基的自我配对，可能对防止RNase降解有一定作用。另外，在编码基因的5'和3'端各有一段非翻译序列，该序列对稳定RNA分子也有一定作用。
另一种RNA噬菌体Qβ的基因组略大，与上述RNA噬菌体的基因组有以下不同;[1]没有独立的溶解蛋白基因，但结构蛋白A2(或称成熟蛋白，MaturaitonProtein)即具有溶解蛋白的功能，[2]还编码另一种外壳蛋白A1。
A基因型(Aa和Ae亚型)与D基因型乙肝病毒感染
A基因型乙肝病毒(HBV/A)具有两种亚型，分别称为Aa(a代表非洲/亚洲)和Ae(e代表欧洲)。日本名古屋城市大学的Masashi Mizokami博士及其同事通过病例-对照研究，比较了来自多个国家的78例HBV/Aa、78例HBV/Ae和78例HBV/D携带者。
研究人员发现，HBV/Aa携带者的血清HBe抗原(HBeAg)阳性率显著低于HBV/Ae携带者(31%比49%;P=0.033)，30岁以下携带者的差异尤为明显(34%比67%;P=0.029)。HBV/Aa携带者的HBV DNA水平(平均:3.46 log copies/mL;95%CI:2.93-3.95)显著低于HBV/Ae携带者(6.09 log copies/mL;95%CI:4.24-7.64)或HBV/D携带者(5.48 log copies/mL;95%CI:4.06-7.02)，并且与HBeAg状态无关(P<0.001)。54例HBV/Aa隔离群的最特异、最常见的置换为位于前C区起始密码子上游的T1809(100%)和T1812(96%)双置换，它能够影响HBV/Aa感染者的HBeAg转录。57例HBV/Ae和61例HBV/D隔离群未出现这些突变。HBV/Aa(50%)和HBV/Ae(44%)患者的核心启动子双突变(T1762/A1764)出现率高于HBV/D隔离群(25%;P<0.01)，而HBV/D隔离群仅出现前C区突变(A1896)(48%;P<0.0001)。
Mizokami博士等认为，HBV/Aa、HBV/Ae、HBV/D感染者通过不同机制清除血清HBeAg，并因此影响患者的临床表现。
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