DGGE主成分分析(SPSS软件)
DGGE图谱的主成分分析
(1) 在Excel
表
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中,,列标为泳道,行标为条带,每个泳道中有条带的表示为1,无条带
表示为0。
(2) 将每一列中全部为0或全部为1的列删掉,只保留部分为0和部分为1的列
(3) 打开SPSS,将1,0数据粘贴到SPSS数据表中,最左面一列表示各个处理
(4) 选中数据,点击工具栏中analyse——data reduction——factor
(5)descriptives中选择:univariate descriptives
Initial solution
Coefficients
(6) extraction中选择:
Principal components
Correlation matrix/unrotated factor solution Number of factor:2
(7)Scores…..中选择: Save as Variables
Regression
(8)点击OK
结果中出现factor1-1,factro2-1,同时在output中
记录
混凝土 养护记录下载土方回填监理旁站记录免费下载集备记录下载集备记录下载集备记录下载
主成分贡献率
(9)点击工具栏中graphs——Scatter
选择simple,点击define
Factor1-1进入Y Axix
Factor2-1进入X Axix Var00001进入set markers by
点击OK,即出现主成分分析图谱