nullnull第九章 ChemDraw软件的使用简介第九章 ChemDraw软件的使用简介郭永明
2013.11.20null9.1 ChemDraw软件的下载及安装软件下载:
邮箱:huaxuexinxi2013@163.com (密码:huaxue2013)
网盘-软件-下载null9.2 主界面绘图窗口主工具栏
(绘图工具)常用工具栏格式工具栏菜单栏null9.2.1 绘图工具null*键工具模板工具箭头工具轨道工具画图工具基元工具符号工具弧形工具原子反应工具9.2.2 其他工具null9.2.3 菜单栏null9.2.3 菜单栏null9.2.3 菜单栏null9.2.3 菜单栏null9.2.3 菜单栏null9.2.3 菜单栏null9.2.3 菜单栏null9.2.3 菜单栏null*点位:移动鼠标直到鼠标的光标放到所要进行操作的位置,
如果选择的位置在图形结构中的键、原子、线等的上面,
一般出现黑方块,称之为光标块,选择块或操作块。 光标块9.3 操作常用术语null*单击:快速按下鼠标键(左或右键),然后快速抬起;双击:快速操作两次单击;拖动:由三部分动作组成——按下鼠标左键选择对象,
移动鼠标,将被选的对象移动到指定位置后抬起鼠标;选择:用鼠标的光标选中某种选择,使对象产生光标。选择对
象并不意味着动作,只是标记要操作的对象和点位;9.3 操作常用术语9.4 结构式的绘制9.4 结构式的绘制4-Hydroxy-4-methyl-pentan-2-one9.3 结构式的绘制9.3 结构式的绘制画骨架9.4 结构式的绘制9.4 结构式的绘制输入单键输入双键输入官能团9.4 结构式的绘制更改字体大小等9.4 结构式的绘制9.4 结构式的绘制选择9.4 结构式的绘制9.4 结构式的绘制9.4 结构式的绘制9.4 结构式的绘制9.4 结构式的绘制9.4 结构式的绘制9.4 结构式的绘制预测化合物的1H和13C-NMR9.4 结构式的绘制9.4 结构式的绘制化合物的命名【Structure】/【Convert Structure to Name】9.4 结构式的绘制9.4 结构式的绘制预测化合物的1H-NMR9.4 结构式的绘制9.4 结构式的绘制预测化合物的13C-NMR9.4 结构式的绘制9.4 结构式的绘制输入化合物的英文名称,点击“Structure”下拉菜单中的“Convert Name to Structure”即可;由化合物的名称
画结构式9.4 反应方程式及反应机理的绘制9.4 反应方程式及反应机理的绘制DMSO9.4 反应方程式及反应机理的绘制9.4 反应方程式及反应机理的绘制9.4 反应方程式及反应机理的绘制9.4 反应方程式及反应机理的绘制9.5 中间体的画法 9.5 中间体的画法 9.5 中间体的画法 9.5 中间体的画法 9.5 中间体的画法 9.5 中间体的画法 9.6 画共振结构式9.6 画共振结构式null9.7 分子轨道的绘制null9.8 画多点配位结构(1)【Object】/【Fixed Lengths】(取消固定键长),以便从环内延长键至环外,也可以在拖动时按下【Alt】(取消固定键长)
(2)选择单键工具,移动指针指向星号,按下【Alt】键,创建一个新键,如图c。
(3)在新键的另一端输入“Fe”,得到图d。重复a-c的操作,得e。null9.9 画费歇尔投影式
(1)利用模板工具中的”Conformers”,选择费歇尔投影式的结构主干,再在空白处单击即可;
(2)选用文本工具,分别点击最上面与最下面的C原子,输入“CHO”及“CH2OH”;
(3)在其他位置输入“H”,再用文本工具分别双击需要添加H原子的C原子(应用文本工具双击将重复最后一次标签),如图c
(4)“OH”的添加与“H”类似。9.10 画透视图9.10 画透视图(1)选用六元环工具,单击鼠标左键,选择合适的角度,释放左键,得图a。
(2)输入O原子符号,得图b。
9.10 画透视图9.10 画透视图(1)选择单键工具,为该环依次添加竖直键;
(2)最后一个向下的键(5位),应将“Object”中的“Fixed Lengths”关闭,再进行绘制,否则改建将会和C3原子向上的键连接在一起。9.10 画透视图(1)用选择工具选择所有结构,向上拖动结构下部中间改变对象大小的手柄,直到将结构扭曲成原来大小的50%。
(2)注意:即使画键时已经考虑到键的长短问题,但在扭曲之后仍会遇到两键相连的问题。因此,在画键时可按住“Alt”键取消固定键长。9.10 画透视图9.10 画透视图(1)添加原子标签OH与CH2OH;
(2)选用粗单键工具,指向前面中间的键时,即可变为粗键。
(3)选用粗楔形键(楔合键)工具,单击环上的两个与粗键相连的键,指向稍微靠宽边的一端单击。若楔合键指向了错误的方向,再次点击该楔合键可使其方向反过来。9.10 画透视图9.11 画纽曼投影式 以乙烷的纽曼投影式为例,练习复制、旋转、拖动等技巧。 创建第一个结构利用单键工具,创建第一个结构,如图a。9.11 画纽曼投影式9.11 画纽曼投影式 复制结构 点击选择工具,最近画的结构自动被选定,按【Ctrl】键的同时,向右上方拖动结构,复制该结构(图b),并用单键工具将两个结构中心的C原子连接(图c)。此时固定键长与键角的设定不起作用。9.11 画纽曼投影式9.11 画纽曼投影式画一个圆 点击轨道工具 ,将指针指向下部的中心碳原子并向外拖动。9.11 画纽曼投影式9.11 画纽曼投影式选定上面碎片中的三个键 点击方框(或套绳)选择工具 ,指针指向结构上方,并环绕上部的碎片拖动选中三个键。连接两个碎片之间的键不选择。9.11 画纽曼投影式9.11 画纽曼投影式旋转选定的对象(1)双击选择框上的旋转手柄,打开旋转对话框,在文本框中输入180°,选择CW,并点击【Rotate】按钮。此过程中,选择框不会消失。9.11 画纽曼投影式9.11 画纽曼投影式(2)旋转完成后点击【Object】/【Bring to Front】,
是选定结构置前。(图e-f-g)9.11 画纽曼投影式9.11 画纽曼投影式 移动选定对象与另一碎片重合(1)指针指向选择框内,至指针变为手形。
(2)拖动选定部分至其中心碳原子处于轨道正中央,释放鼠标,完成绘制。(图h)
注意:两个碎片结构重叠时,会看到红色警告,不影响观察,可执行【View】/【Show Chemical Warnings】关闭自动警告。(图i)9.11 画纽曼投影式9.12 使用立体化学标记9.12 使用立体化学标记介绍使用立体化学标记(Stereochemistry)和翻转(Flip)命令的使用。 添加原子标注 画骨架结构 添加立体楔形键(契合键)9.12 使用立体化学标记 添加一个立体化学标记(1)选择完整结构(图a),执行【Object】/【Show Sterochemistry】时,得到结构b;
(2)选定该结构(图b),执行【Object 】/【Flip Horizontal】(水平翻转),得到结构c;
(3)选定结构(图c),执行【Object 】/【Flip Vertical】(竖直翻转),得到结构d。9.12 使用立体化学标记null使用模板时提高绘制效率的最好办法。
先利用相近的模板创建骨架,再进行相关的修改。9.13 使用模板菲 过氧化二苯9.14 绘制实验装置9.14 绘制实验装置 ChemDraw可以用磨口玻璃仪器接插件迅速搭建化学反应装置。蒸馏装置9.14 绘制实验装置9.14 绘制实验装置null 如果不改变图形模板的话,在绘图区每单击一次鼠标,就会出现一个选定模板的图形。单击鼠标左键后不松手,则可以通过移动鼠标使图形旋转,待转动到希望的位置时松手即可。9.15 图形的旋转或缩放null撤销操作,单击 【Undo】。 画好的图形也可以旋转和缩放。用选取框或套索选中图形,此时图形被一虚线框笼罩,鼠标移至方框的右上角会变成双箭头,单击鼠标可以旋转图形。右下角为缩放控制点,拖动这个角可以按比例改变图形大小。9.15 图形的旋转或缩放null ChemDraw可以检查绘制的结构是是否有问题,选中结构式后,进行【Structure】/【Check structure】菜单命令,ChemDraw就会将一个红色方框罩在有问题的源自或官能团上,便于用户检查。该功能是自动执行的,如果结构式中有红色方框罩住的原子或官能团,在绘制时应引起注意。9.16 检查结构错误和整理结构式null ChemDraw可以对化合物结构进行分析计算。
选中化合物结构式,【View】/【Show Analysis Window】,弹出分析窗口,包含该化合物的分子简式、摩尔质量、同位素分布图,元素分析组成比例等数据。
【View】/【Show Chemical Properties Window】,弹出化学性质窗口,包含该化合物的沸点、熔点、临界温度、临界压力、临界体积、Gibbs自由能、LogP、MR、Herry’s Law、生成热、ClogP、CMR等。9.17 分析结构估计性质null9.17 分析结构估计性质9.18 基本技巧——选择对象9.18 基本技巧——选择对象1. 选择对象
通过选择工具圈取所要选择的地方即可;
选择多个对象:先按shift键,再选择其他对象,通过使用选择工具可添加选择对象。
选择所有对象:【Edit】/【Select All】2.取消选择对象
在选定对象外任意空白处单击。
按Esc键。
按下shift键,选择另一个对象。只取消其中一个对象,可在按下shift键的同时点击对象。9.18 基本技巧——选择对象3.对象排列方式
选定对象
对象页面居中:【Obiect】/【Center on Page】
对象页面对齐: 【Obiect】/【Align】
等距分散对齐: 【Obiect】/【Distribute】(Vertically或Horizontally)
选定对象置前: 【Obiect】/【Bring to Front】
选定对象置后: 【Obiect】/【Send to Back】9.18 基本技巧——选择对象9.18 基本技巧——选择对象9.18 基本技巧——选择对象4.改变对象的大小
通过拖动任意一个角可改变对象的大小比例
通过拖动任意一条边可使对象在X轴或Y轴方向上扭曲。
按下shift键的同时拖动,可随意改变大小
右键点击选定对象,选【Scale】,在Scale Object对话窗口中输入百分比。9.18 基本技巧——选择对象5.移动对象
选择对象,点击拖动对象至新的地方。移动同时按下shift键可保持水平或垂直不变。
移动单个原子:选择要移动的原子,并拖动。则与原子相连的键也随之被拉伸。
拖动一个原子到相邻原子可改变环的类型。(如六元环变五元环。)9.18 基本技巧——选择对象9.19 基本技巧——化学键1.化学键的属性
固定键长(并非化学意义上的键长):
【Object】/【Fixed Lengths】;
使用单键工具画一个结构,其中的键长为标准键长。
固定键角:强制键角画键,相对于X轴为15°的倍数。
【Object】/【Fixed Angles】
化学键属性的设置:
【File】/【Doucment Settings】/【Drawing】
在Fixed Length(默认0.4167in)、Fixed Angles框中输入数值(默认120 ° )。 9.19 基本技巧——化学键9.19 基本技巧——化学键2.画化学键
双任意键:
从多重键工具中,选择Double Either Bond工具画键;
使用波浪键画键,鼠标指向键的中心,点击变为双键,再次点击变为双任意键。
配位键和楔形键(楔合键):
点击配位键工具(Dative Bond),从配位键的正端拖向负端;
点击楔形键工具,从楔形键的窄端拖向宽端;
使用上两键工具,点击键的中心位置,可改变键的取向。 9.19 基本技巧——化学键9.19 基本技巧——化学键3.修改化学键
改变键型:
选择键工具,单击一个已经存在的键的中心,或单击右键或按Ctrl+单击从弹出菜单中选择新键,可改变单键类型。
使用粗键、虚键或实键工具电议一个双键,可改变双键键型。
改变双键对齐方式:
点击创建该键的键工具,点击已存在的双键;
单击双键中心改变一种,再次单击,再次改变;
使用命令【Bond Position】。 9.19 基本技巧——化学键9.19 基本技巧——化学键改变键的交叉方式:
当一个键横跨另一个键时,白色空白
表
关于同志近三年现实表现材料材料类招标技术评分表图表与交易pdf视力表打印pdf用图表说话 pdf
示该键在另一个键背面。点击任何一个键工具,双击一个在背面的键可将其置于前面;
使用【Object】中的【Bring to Front】或【Send to back】命令也可以改变键的前后位置。
化学警告:
关闭自动警告选项:【View】/【Show Chemical Warnings】;
对特定对象取消警告:右键单击对象,取消选择【Display Warning】
查看对警告的描述:【Explain This Warning】
改变警告类型: 【File】/【Preferences】,淡出对话框中选择【Chemical Warnings】,进行勾选。9.19 基本技巧——化学键9.19 基本技巧——化学键画芳香结构不定域环
点击环工具,按下Ctrl键的同时拖动攻击点击画环。
直接使用环工具画环按下Ctrl键的同时画环9.19 基本技巧——化学键9.20 图形存盘9.20 图形存盘 画好的分子结构图形可以保存为文件,以备将来使用或修改。ChemDraw文件的扩展名为“cdx”。
【File】/【Save As】,弹出【另存为】对话框,即可保存。【保存类型】有多种选项,可另存为Chem Draw 3.x版的格式(“chm”),或“gif”、“bmp”图形格式,或另存为ISIS格式。9.20 图形存盘9.20 图形存盘null1、2、3、4、5、作业请在12月1号24点之前交注意:放在03版word中null