ICS65.020.30
B43
囝目
中华人民共和国国家
标准
excel标准偏差excel标准偏差函数exl标准差函数国标检验抽样标准表免费下载红头文件格式标准下载
GB/T27642—201 1
牛个体及亲子鉴定微卫星DNA法
BovineindividualandparentalidentificationusingmicrosatelliteDNA
2011-12-30发布 2012-04—01实施
宰瞀髁鬻瓣警矬瞥星发布中国国家标准化管理委员会促19
目次GB/T27642--2011前言⋯⋯⋯··⋯⋯·⋯⋯·⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯··Ⅲ1范围⋯⋯··⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯··⋯⋯12规范性引用文件⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯··13术语、定义和缩略语⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯··⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯·⋯⋯·⋯⋯⋯⋯⋯⋯·14原理⋯⋯⋯⋯⋯···⋯一⋯··⋯⋯⋯一一·⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·一··⋯⋯-⋯-⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯-·⋯一一·25防污染措施⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯···⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯·⋯⋯⋯⋯⋯26个体鉴定和亲子鉴定试验步骤⋯⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯·⋯⋯··⋯⋯·⋯⋯··⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯-.2附录A(资料性附录)试剂配制及仪器⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯··4附录B(资料性附录)DNA样品的制备·⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·6附录C(资料性附录)光谱校正和PCR反应、测定及
分析
定性数据统计分析pdf销售业绩分析模板建筑结构震害分析销售进度分析表京东商城竞争战略分析
⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯⋯⋯·⋯⋯·8附录D(资料性附录)FA0一IsAG推荐的牛微卫星DNA标记⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯··lo附录E(资料性附录)个体及亲子鉴定计算方法·⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·⋯⋯·⋯⋯⋯⋯⋯⋯12????? www.bzfxw.com ????
前言本标准按照GB/T1.1—2009的规则进行起草。本标准由全国畜牧业标准化技术委员会(sAc/Tc274)归口。本标准起草单位:全国畜牧总站。本标准主要起草人:刘丑生、王志刚、孙飞舟、邱小田、韩旭、于福清、张桂香。GB/T27642—2011Ⅲ ????? www.bzfxw.com ????
1范围牛个体及亲子鉴定微卫星DNA法本标准
规定
关于下班后关闭电源的规定党章中关于入党时间的规定公务员考核规定下载规定办法文件下载宁波关于闷顶的规定
了利用微卫星DNA标记进行牛个体及亲子鉴定的技术规程。本标准适用于普通牛(Bostaurus)个体和亲子鉴定。2规范性引用文件GB/T27642--2011下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GA/T383法庭科学DNA实验室检验规范SN/T1193基因检验实验室技术要求3术语、定义和缩略语下列术语、定义和缩略语适用于本文件。3.1聚合酶链式反应polymerasechainreaction,PCR以一对寡核苷酸引物、四种脱氧核糖核苷酸(dNTPs)为原料,在合适的温度、离子条件和耐热DNA聚合酶催化下,在体外人工合成特异的DNA片段的过程。3.2微卫星DNAmicrosatelliteDNA亦称短串联重复序列或简单重复序列(shorttandemrepeats,STRs;simplesequencerepeats,SSRs),以1bp~6bp的短核苷酸序列为基本单位,呈串联重复状散在分布于生物体基因组中。3.3非父排除概率probabilityofpaternityexclusion,PE通过检测某一个遗传标记,能将不是生父的争议父亲排除的概率。3.4累积非父排除概率cumulativeprobabilityofpaternityexclusion,CPE通过检测某一遗传标记系统的多个遗传标记,将不是生父的个体否定掉的累计概率。3.5亲权指数paternityindex,PI争议父亲提供生父等位基因成为子代生父的概率与随机公畜提供生父基因成为子代生父概率的比值。3.6累积亲权指数cumulativepaternityindex,CPI根据某一遗传标记系统中的多个标记,计算多个亲权指数的累积。3.7父子关系相对概率relativechanceofpaternity,RCP争议父亲是亲生父亲的相对概率。1 ????? www.bzfxw.com ????
GB/T27642--20114原理4.1个体鉴定原理某一被检样品与真样品微卫星标记的基因型不同,则判定被检样品与真样品来自不同个体,如果相同不排除它们来自同一个体,通过对某一遗传标记系统的多个标记所检测,可在一定概率水平上判定被测样品与真样品是否来自同一个体。4.2亲子鉴定原理根据孟德尔遗传分离定律,在配子细胞形成时,成对的等位基因彼此分离,随机进入配子细胞。双亲的配子细胞结合形成合子,其发育出来的子代的成对等位基因分别来自父亲和母亲。根据多个标记计算的鉴定结果在一定概率水平上可以判定争议父亲(母亲)是否为亲生父亲(母亲)(变异情况除外)。5防污染措施按SN/T1193和GA/T383规定的方法执行。6个体鉴定和亲子鉴定试验步骤6.1样品制备收集血液、组织(耳、肌肉、尾、皮肤等)、毛囊或精液等
材料
关于××同志的政审材料调查表环保先进个人材料国家普通话测试材料农民专业合作社注销四查四问剖析材料
。6.2样品DNA的制备各样品试剂配方、所需的仪器设备参见附录A,具体步骤参见附录B。6.3光谱校正在实验前进行一次四色荧光素的光谱校正,目的为了校准信号重叠。具体步骤参见C.1。6.4微卫星DNA标记参见附录D。6.5PCR反应6.5.1PCR反应体系参见
表
关于同志近三年现实表现材料材料类招标技术评分表图表与交易pdf视力表打印pdf用图表说话 pdf
C.1。6.5.2PCR反应程序参见表C.2。6.5.3PCR产物电泳检测取适量PCR产物,上样于1%~3%的琼脂糖凝胶中进行电泳,检测本次扩增反应是否成功。
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6.6测定殛分析通过分析得到微卫星标记的基因型频率。参见C.3。6.7利用微卫星DNA法进行个体鉴定的概率计算和结果表述GB/T27642--2011被检样品的基因型与真样品不同,可排除两份样品来源于同一个体(变异情况除外)。如果两份样品的基因型相同时,则按式(1)计算偶合概率,当其值小于该个体所在群体数量的倒数时(5×10_9),认定两份样品来源于同一个体。偶合概率是一组微卫星标记基因型频率的乘积。PM—P1×P2×P。×⋯⋯×P。⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯(1)式中:Pu——偶合概率}P——第i个微卫星标记的基因型频率。6.8利用微卫星DNA法进行亲子鉴定认定和排除依据累积非父排除率≥99.73%、父子关系相对概率≥99,95%或累积亲权指数≥2000,判定争议父亲为生父;累积非父排除率低于99.73%并且有3个以上标记不符合孟德尔遗传分离规律时,排除亲缘关系;如果累积非父排除率低于99.73%并且有3个以下的作为不符合孟德尔遗传分离规律时,应适当增加检测的标记数量。具体计算公式参见附录E。
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GB/T27642—2011
A.1试剂配制
A.1.1血液裂解液见表A.1。
附录A
(资料性附录)
试剂配制及仪器
表A.1血液裂解液
体积
贮存液浓度 使用浓度
mL
1mol/LTris—HCI(pH8.o) 1 10mmol/L
0.5mol/LEDTA(pH8.o) 20 i00mmol/L
10%SDS 20 2%
灭菌双蒸水加至 i00
A.1.2组织DNA及毛囊提取液见表A.2。
表A.2组织DNA提取液
体积
贮存液浓度 使用浓度
mL
1mol/LTris-HCl(pH8.O) 5 50mmol/L
0.5mol/LEDTA(pH8.0) 20 100mmol/L
0.5mol/LNaCI 20 100mmol/L
10%SDS 20 2%
灭菌双蒸水加至 lOO
A.1.3精子裂解液见表A.3。
表A.3精子裂解液
体积
贮存液浓度 使用浓度
mL
1mol/LTris-HCl(pH8.0) 1 10mmol/L
0.5mol/LEDTA(pH8.0) 2 10mmol/L
0.5mol/LNaCl 20 100retool/L
10%sDs 20 2%
1mol/LDTT(现用现加) 0.0039 39ptmol/L
灭菌双蒸水加至 100
4
GB/T27642—2011
A.1.4精子洗涤液
取1mol/L的NaCI37.5mL,0.5mol/L的EDTA5mL,加双蒸水至250mL。高压灭菌备用。
A.1.5蛋白酶K贮存液(20mg/mL)
200mg蛋白酶K溶于10mL灭菌双蒸水中,分装,每管1mL,--20℃冻存。
A.1.6TE缓冲液(pH8.o)
10mmol/LTris—HCl(pH8.O),1mmol/LEDTA(pH8.O)。
A.1.7电泳缓冲液
1×Tris_乙酸(TAE):0.04mol/LTris-乙酸,0.01mol/LEDTA。
0.5XTris一硼酸(TBE):0.045mol/LTris-硼酸,0.01mol/LEDTA。
A.1.8溴化乙锭溶液(EB,10mg/mL)
用少量双蒸水溶解1g溴化乙锭,磁力搅拌数小时以确保其完全溶解,定容至100mL,然后转移到
棕色瓶或铝箔包裹容器中,室温保存。
A.1.96X上样缓冲液
0.05%溴酚蓝,0.12%二甲苯青FF,40%(质量浓度)蔗糖水溶液;
或0.05%溴酚蓝,0.12%二甲苯青FF,30%(体积分数)甘油水溶液。
A.1.101mol/L二硫苏糖醇(DTT)
用20mL0.01mol/L乙酸钠溶液(pH5.2)溶解3.09gDTT,过滤除菌后分装成1mL贮存于
一20℃。注意:DTT或含有DTT的溶液不能进行高压处理。
A.1.111 tool/LTris(pH8.0)
将121.1gTris溶于800mL水中,加浓盐酸调pH值至8.0,定容至1000mL后高压灭菌。
A.1.120.5mol/LEDTA(pH8.O)
将186.1gNa。EDTA·2HzO,加入800mL水中,再加入NaOH(约20g)调pH值至8.0,定容后
高压灭菌。
A.1.1310%SDS(500mL)
将50gSDS加入400mL水中,60℃加热溶解,定容后过滤灭菌。
A.1.14Tris饱和酚。
A.1.15酚:三氯甲烷:异戊醇(25:24:1)混合液。
A.1.16三氯甲烷:异戊醇(24:1)混合液。
A.2仪器
A.2.1遗传分析仪。
A.2.2PCR仪。
A.2.3低温高速离心机。
A.2.4生物分光光度计。
A.2.5稳压稳流电泳仪。
A.2.6八道电子可调移液器(量程5pL~100pL)。
A.2.7八道电子可调移液器(量程0.2pL~10pL)。
A.2.8单道可调移液器(2pL,10pL,200卜L,1000弘L)。
A.2.9电子天平(量程0.01mg~300rag)。
A.2.10水浴恒温震荡器。
A.2.11普通离心机。
A.2.12紫外光检测仪。
A.2.13超声波清洗器。
A.2.14超纯水器。
A.2.15高压灭菌器。
5
GB/T27642--2011
B.1样品预处理
附录B
(资料性附录)
DNA样品的制备
B.1.1从血液中提取基因组DNA
B.1.1.1取适量血液加入等体积血样裂解液,加入RNA酶至终浓度为20pg/mL,充分混匀,于37℃
水浴消化1h~2h。
B.1.1.2加入蛋白酶K贮存液至终浓度为100t,g/raL,充分混匀,55℃水浴消化12h以上至不见粘
稠的团块。
B.1.2从组织中提取基因组DNA
B.1.2.1取0.3g的组织置于1.5mL离心管中,将其破碎。
B.1.2.2晾干后加入500pL组织DNA提取液,然后加入RNA酶至终浓度为20pg/mL,充分混匀,
37℃水浴消化1h。
B.1.2.3加蛋白酶K贮存液至终浓度为150pg/mL~200pg/mL,充分混匀,55℃水浴消化12h以上
至不见有组织块。
B.1.3从毛囊中提取基因组DNA
B.1.3.1用灭菌双蒸水洗涤毛囊,剪碎,置于小离心管中。
B.1.3.2晾干后加入30/tL~50pL组织DNA提取液,然后加入蛋白酶K至终浓度为200pg/mL,充
分混匀,55℃水浴消化12h以上至毛囊完全溶解。
B.1.4从精液中提取基因组DNA
B.1.4.1
B.1.4.2
B.1.4.3
B.1.4.4
B.1.4.5
每一个体取冻精三粒或鲜精0.4mL,置于1.5mL离心管中。
加等量精子洗涤液,4500r/rain离心6rain,弃上清液。
重复洗涤精子沉淀两次,去掉其中的卵黄甘油等物质。
用0.4mL精子裂解液重悬沉淀。
加入蛋白酶K贮存液至终浓度为100btg/mL,充分混匀,55℃水浴消化过夜至少12h。
B.2样品抽提
B.2.1加入等体积Tris饱和酚,反复颠倒离心管,使两相溶液充分混合形成乳浊液,4℃4500r/rain
离心15mimd、心吸取上清液转移至另一洁净的离心管中;重复该操作一次。
B.2.2加入等体积的酚:三氯甲烷:异戊醇(25:24:1)混合液,缓慢颠倒离心管,使两相溶液充分
混合,4℃4500r/min离心15min。
B.2.3加入等体积三氯甲烷:异戊醇(24:1)混合液,缓慢颠倒离心管,使两相溶液充分混合,4℃
4500r/rain离心15rain;收集上清至另一离心管中。
B.2.4将上清液吸至较大容量的试管中,加入1/10体积3mol/LNaAc溶液(pH5.2)和2.5倍体积的
6
预冷无水乙醇,轻轻摇动试管至出现白色絮状DNA沉淀。
B.2.5将DNA沉淀转移到1.5mL离心管中,用75%乙醇洗涤两次。
B.2.6将DNA干燥后加入适量TE缓冲液或灭菌双蒸水室温溶解24h。
B.3样品基因组DNA浓度检测
GB/T27642—2011
吸出适量提取的DNA,稀释50倍,用生物分光光度仪检测DNA的浓度,根据测定结果再将DNA
溶液稀释至预定值。较纯DNA样品的A:。。/A。比值为1.8左右;若该比值大大低于1.8,说明样品中
含有较多的蛋白质,应进一步纯化。
H—A250×N×50⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯(B.1)
式中:
H——DNA浓度,单位为微克每毫升(ug/mL);
N——稀释倍数。
对于双链DNA来说,1OD=50ug/mL。
B.4样品基因组DNA纯度和质量检测
吸出适量提取的DNA,在琼脂糖凝胶中进行电泳,然后在紫外透视仪下检测DNA质量,如果
DNA条带比较整齐、亮度较高,DNA样品的At。。/A。。比值为L8左右,则说明提取的DNA样品可以
用于牛个体及亲子鉴定。
GB/T27642--201 1
c.1 光谱校正的具体步骤
附录C
(资料性附录)
光谱校正和PCR反应、测定及分析
C.1.1将标准品中的4支离心管充分混合离心。
C.1.2从4管中各取混合好的标准标记品(内含5FAM,JOE,NED,ROX)l_25pL,再加195pL的高
纯度甲酰胺转移至另一1.5mL的离心管中。
c.1.3充分混匀离心。
c.1.495℃变性5min,4℃保存10min。
C.1.5取10pL变性产物加到96孔上样板上,把96孔上样板放到遗传分析仪中。
C.1.6毛细管电泳参考条件:
——毛细管:长度36cm,内壁无涂层;
——推荐炉温:60℃。
C.1.7如果校正结果能够达到仪器所要求的参数范围,则预实验通过。标准品测试结果要求Q值>
0.95,C值在4~8.5之间。
C.2 PCR反应体系及反应程序
表c.1PCR反应体系
单倍反应体系
组 分
“L
PCRBuffer 0.5
dNTPs(10retool/L) 1.2
AmpliTaqGoldDNA聚合酶(2.5U/^tL) 0.1
11对引物的混合物 1.7
去离子水 0.5
样品基因组DNA 1.0
总体积 5.0
表C.2PCR反应程序
35个~40个循环
预变性 最后延伸 加尾 保存
变性 退火 延伸
95℃ 94℃ 55℃~63℃ 72℃ 72℃ 25℃
4℃
15rain 45s 45s 60s 60rain 2h
8
C.3测定及分析
GB/T27642--2011
C.3.1测定
将PCR产物稀释15倍,从中取1pL与11.5pL甲酰胺和0.25pL分子量内标混合,95℃变性
2min~5rain,立即放4℃10rain。
c.3.2分析
以样品峰长度值和分子量内标的峰长度值比较定量。得到各标记的等位基因片段大小,计算基因
型频率。
GB/T27642—20”
附录D
(资料性附录)
FAO-ISAG推荐的牛徽卫星DNA标记
表D.1 FAO-ISAG推荐的牛微卫星DNA标记
标记 退火温度
等位基因
序号 染色体 引物序列(上下游序列均为5’一3’) 范围
名称
vp
INRA063 ATTTGCACAAGCTAAATCTAACC
1 18 55~58167~189
(D18S5) AAACCACAGAAATGCTTGGAAG
INRA005 CAATCTGCATGAAGTATAAATAT
2 12 55 135~149
(D12S4) CTTCAGGCATACCCTACACC
ETH225 GATCACCTTGCCACTATTTCCT
3 9 55~65131~159
(D9S1) ACATGACAGCCAGCTGCTACT
ILSTS005 GGAAGCAATGAAATCTATAGCC
4 10 54~58176~194
(D10S25) TGTTCTGTGAGTTTGTAAGC
HEL5 GCAGGATCACTTGTTAGGGA
5 21 52~57145~171
(D21S15) AGACGTTAGTGTACATTAAC
HELl CAACAGCTATTTAACAAGGA
6 15 54~5799~119
(D15SLO) AGGCTACAGTCCATGGGATT
INRA035 ATCcTTTGCAGCCTCCACATTG
7 16 55~60100~124
(D16S1I) TTGTGCTTTATGACACTATCCG
ETHl52 TACTCGTAGGGCAGGCTGCCTG
8 5 55~60181~211
(D5SI) GAGACCTCAGGGTTGGTGATCAG
INRA023 GAGTAGAGCrACAAGATAAACTTC
9 3 55 195~225
(D3S10) TAACTACAGGGTGTTAGATGAACTC
ETHl0 GTTCAGGACTGGCCCTGCTAACA
10 5 55~65207~23l
(D5S3) CCTCCAGCCCACTTTCTCTTCTC
HEL9 CCCATTCAGTCTTCAGAGGT
11 8 52~5714l~173
(D8S4) CACATCCATGTTCTCACCAc
CSSM66 ACACAAATCCTTTCTGCCAGCTGA
12 14 55~65171~209
(D14S31) AATTrAATGCACTGAGGAGCTTGG
INRA032 AAACTGTATTCTCTAATAGCTAC
13 11 55~58160~204
(D11S9) GCAAGACATATCTCCATTCCTTT
ETH3 GAACCTGcCTCTCCTGCATTGG
14 19 55~65103~133
(D19S2) ACTCTGCCTGTGGCCAAGTAGG
BM2113 GCTGCCTTCTACCAAATACcC
15 2 55~60122~156
(D2S26) CTTCCTGAGAGAAGCAACACC
BMl824 GAGCAAGGTGTTTTTCCAATC
16 1 55~60176~197
(DIS34) CATTCTCCAACTGCTTCCTTG
10
表D.1(续)
GB/T27642—2011
标记 退火温度
等位基因
序号 染色体 引物序列(上下游序列均为57斗37) 范围
名称
HELl3 TAAGGACTTGAGATAAGGAG
17 1l 52--57178~200
(D11S15) CCATCTACCTCCATCTTAAC
INRA037 GATCCTGcTTATATTTAACCAC
18 10 57~58112~148
(D10S12) AAAATTCCATGGAGAGAGAAAC
BMl818 AGCTGGGAATATAACCAAAGG
19 23 56~60248~278
(D23S21) AGTGCTTTCAAGGTCCATGc
ILSTS006 TGTCTGTATTTCTGCTGTGG
20 7 55 277--309
(D7S8) ACACGGAAGCGATCTAAACG
MMl2 CAAGACAGGTGTTTCAATCT
21 9 50~55101~145
(D9S20) ATCGACTCTGGGGATGATGT
CSRM60 AAGATGTGATCCAAGAGAGAGGCA
22 10 55~6579~115
(D10S5) AGGACCAGATCGTGAAAGGCATAG
ETHl85 TGCATGGACAGAGCAGCCTGGC
23 17 58~67214~246
(D17S1) GCACCCCAACGAAAGCTCCCAG
HAUT24 CTCTCTGCCTTTGTCCCTGT
24 22 52~55104~158
(D22S26) AATACACTTTAGGAGAAAAATA
HAUT27 TTTTATGTTCATTTTTTGACTGG
25 26 57 120~158
(D26S21) AACTGCTGAAAT(?rCCATCTTA
TGLA227 CGAATTCCAAATCTGTTAATTTGCT
26 18 55~56 75~105
(D18S1) ACAGACAGAAACTCAATGAAAGCA
TGLAl26 CTAATTTAGAATGAGAGAGGCTTCT
27 20 55~58115~131
(D20S1) TTGGTCTCTATTCTCTGAATATTCC
TGLAl22 CCCTCCTo:AGGTAAATCAGC
28 21 55~58136~184
(D21S6) AATCACATGGCAAATAAGTACATAC
TGLA53 GCTTTCAGAAATAGTTTGCATTCA
29 16 55 143~191
(D16S3) ATCTTCACATGATATTACAGCAGA
SPSll5 AAAGTGACACAACAGCTTCTCCAG
30 15 55~60234~258
(D15) AACGAGTGTCCTAGTTTGGCTGTG
TTCcTCTGAGTCTCTGACAC
31 MCMl58 Y 56~60112~148
CCGAGATTGAAATGTAAATGAG
ATTGACACTTCAGTAAGTTA
32 MAF45 Y 55~58122~142
CAGACACAACTGAGCAAcTAGC
GATCCATCCACATTGCTCCA
33 UMN0108Y 58~67158~209
CCAAGCGTCCATCAATTTAC
ACCAGCTGATACACAAGTGC
34 UMN0929Y 55~58174~196
GGTCAGAGAATGAAACAGAG
11
GB/T27642—2011
附录E
(资料性附录)
个体及亲子鉴定计算方法
E.1个体、母亲和假定父亲的基因型均已知的情况
E.1.1根据单个微卫星DNA标记计算的非父排除概率公式见式(E.1)
⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯(E.1)
式中:
PE——第k个微卫星DNA标记的非父排除概率;
P。——第k个微卫星DNA标记第i个等位基因的频率;
n——标记数。
E.1.2根据k个微卫星DNA标记计算的累积非父排除概率的公式见式(E.2):
CPE一1一(1一PEl)(1一PE2)(1一PE3)⋯⋯(1一PE^)⋯⋯⋯⋯⋯(E.2)
式中:
CPE——累积非父排除概率;
PE——第k个微卫星DNA标记的非父排除概率。
E.2个体和一亲本的基因型已知,而另一亲本基因型未知的情况
PE。一1—4∑露+2(∑正)2+4∑霞一3∑硝⋯“
i—I l=1 I=1 t一1
CPE一1一(1一PE-)(1一PEz)(1一PE。)⋯⋯(1一PE。)⋯⋯
PE、P。和CPE同E.1。
E.3两个亲本的基因型均未知的情况
3∑硝
-一1
⋯(E.3)
⋯(E.4)
CPE=1一(1一PE-)(1一PEz)(1一PE3)⋯“(1一PE。)⋯⋯⋯⋯(E.6)
PE、P。和CPE同E.1。
E.4亲权指数(PI)和累计亲权指数(CPI)
12
式中:
PI——亲权指数
PI—P。|P。
CPI—PJl×PI2×⋯⋯PI^
⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯(E.7)
⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯(E.8)
声。∑㈦,L、J声。∑Ⅲ
3+p
。∑一
,L2一声。∑Ⅲ3一声。∑㈦2+p。∑Ⅲ+p。∑㈨2一一|量1
5E
、J
.
露
~。∑㈨~
(
一
2
¨
+
~
、Jp。∑㈦,L、J声。∑Ⅲ,L8+、)声。∑Ⅲ,L8p,∑㈨
4一p。∑Ⅲ
4+1一阳
P。——争议父亲提供生父基因的概率
只——该基因在群体中的随机频率;
CP卜 累计亲权指数;
PIt——第k个标记的亲权指数。
E.5父子关系相对机会
式中:
RCP——父子关系相对概率
CPI——累计亲权指数。
GB/T27642—2011
RCP—CPI/(CPI+1)×100%⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯(E.9)