体内20种氨基酸按理化性质可分为4组:
①非极性、疏水性氨基酸:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸和脯氨酸。
②极性、中性氨基酸:色氨酸、丝氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、蛋氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺和苏氨酸。
③酸性的氨基酸:天冬氨酸和谷氨酸。
④碱性氨基酸:赖氨酸、精氨酸和组氨酸。
侧链决定了20种α-氨基酸的化学性质,如下
表
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所示:
残基名称
三字母代码
单字母代码
相对丰度(%) E.C.
分子量
pKa
VdW体积(?3)
带电(C),极性(P),疏水性(H)
丙氨酸(Alanine)
ALA
A
13.0
71
67
H
精氨酸(Arginine)
ARG
R
5.3
157
12.5
148
C+
天冬酰胺(Asparagine)
ASN
N
9.9
114
96
P
天冬氨酸(Aspartate)
ASP
D
9.9
114
4.5
91
C-
半胱氨酸(Cysteine)
CYS
C
1.8
103
8.3
86
P
谷氨酸(Glutamate)
GLU
E
10.8
128
4.5
109
C-
谷氨酰胺(Glutamine)
GLN
Q
10.8
128
114
P
甘氨酸(Glycine)
GLY
G
7.8
57
48
组氨酸(Histidine)
HIS
H
0.7
137
6.8
118
P,C+
异亮氨酸(Isoleucine)
ILE
I
4.4
113
124
H
亮氨酸(Leucine)
LEU
L
7.8
113
124
H
赖氨酸(Lysine)
LYS
K
7.0
129
11.1
135
C+
甲硫氨酸(Methionine)
MET
M
3.8
131
124
H
苯丙氨酸(Phenylalanine)
PHE
F
3.3
147
135
H
脯氨酸(Proline)
PRO
P
4.6
97
90
H
丝氨酸(Serine)
SER
S
6.0
87
73
P
苏氨酸(Threonine)
THR
T
4.6
101
93
P
色氨酸(Tryptophan)
TRP
W
1.0
186
163
P
酪氨酸(Tyrosine)
TYR
Y
2.2
163
9.8
141
P
缬氨酸(Valine)
VAL
V
6.0
99
105
H