水稻反转录子P-SINE1及栽培稻起源

水稻反转录子P-SINE1及栽培稻起源水稻反转录子P-SINE1及栽培稻起源水稻反转录子P—SINE1及栽培稻起源 H.Ohtsubo等野生稻O.rufipogon中存在广泛的种内变异.认为它是具有籼型和粳型两种生态型的栽培稻0.sativa的祖先.P—SINE1是在水稻中鉴定出来的第一个反转录子SINE,它以多拷贝形成存在于具有从基因组的稻属物 SINE1成员显示出水稻材料种中.部分P— 间的插入多态性,从而假定它们是进行品系分类的合适标记,依据相关位点这些成员的存在与否来推断品系间的关系.P—SINE1的亚族成员显示出0....

水稻反转录子P-SINE1及栽培稻起源水稻反转录子P—SINE1及栽培稻起源 H.Ohtsubo等野生稻O.rufipogon中存在广泛的种内变异.认为它是具有籼型和粳型两种生态型的栽培稻0.sativa的祖先.P—SINE1是在水稻中鉴定出来的第一个反转录子SINE,它以多拷贝形成存在于具有从基因组的稻属物 SINE1成员显示出水稻材料种中.部分P— 间的插入多态性,从而假定它们是进行品系分类的合适标记,依据相关位点这些成员的存在与否来推断品系间的关系.P—SINE1的亚族成员显示出0.sativa一0.rufipogon群体中的插入多态性.为了弄清栽培稻的起源,我们依据各个位点的插入多态性,采用P—SINE1成员对101个栽培稻和野生稻材料进行靶一编码(bar—code).应用全部水稻材料的靶一编码构建的系统发育树表明:水稻材料可划分为与粳稻和籼稻相应的两个群,而O.rufipogon 被分为四个群,其中,一个群含有年生0. rufipogon材料,而其余3个群含有多年生0. rufit~gort材料.粳稻材料与一个群的0.r.fi- pogon多年生材料的亲缘关系非常近,籼稻材料与0.mfipogon一年生材料的亲缘关系非常密切,这说明水稻(0.sativa)是从0.rufipogon 多源发生衍生而来的.而且,我们还从具有从基因组的0.barthii,0.吲z,0. 1ongistaminata和0.meridionalis4个野生稻种的代表性材料中鉴定出了显示种间插人多态性的新的P—SINE1.应用多态P—SINE1成员构建的系统发育树表明0.1ongistaminata和 0.meridionalis歧化较早,而包括0.rufipogon 在内的其它物种在进化上时间相对歧化较迟些.我们还构建了水稻基因组序列数据库全部P—SINE1成员图谱,显示出它们存在于所有染色体中,但是同其它逆转录因子不同,在各个染色体的着丝粒附近区域没有分布. 向平摘译自BreedingScience54:1— 11.2004 应用历史资料,分子标记和系谱分析意大利水稻品种的遗传关系 A.Spada等水稻是意大利的一种主要作物,意大利也是欧洲的水稻主产国,种植面积为217.000 公顷,产量为1.221.000吨.同亚洲国家相比,意大利较小的种植面积,缺乏野生稻和从国外引进稻种使得意大利水稻品种成为一种研究基因组关系和系谱的较好模式.意大利的水稻可能是由Spaniards和Arabs在15世纪引进的.然而,到19世纪初有关水稻栽培和品种名称的资料都很少.在这期间水稻新 4 品种主要是从亚洲引进,虽然困难较多,但是也取得了一些成功.直到1925年完成了第一个试图改良现有品种杂交组合之前,意大利的主要水稻育种方法仍是混合选择.所以,为了满足市场发展的需求,意大利水稻育种目标的重点是抗真菌病,高产和优质.部分'创始'品种在提升水稻种质方面发挥了重要作用,最显着的有1904年引进的'Originar— ioChinese',1925年引进了'LadyWright'和

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