水产动物中的QTL

水产动物中的QTL水产动物中的QTL QTL定位是以一定饱和度的遗传连锁图谱为基础,通过连锁分析,确定动物一些与经济性状相关的数量性状位点,即QTL在图谱上的位置与特定标记之间的遗传距离。对于水产养殖动物来说,标记数超过400的中高密度的遗传连锁图谱,可达到对一些数量性状进行初步定位。主要水产养殖动物品种改良的目标性状包括生长快、抗寒、抗病、耐盐碱、肉质好、高饲料转化率、发育速率快/发育时间短等。一般来说,适应性性状(如体长、体重)和抗逆性性状(如抗寒、抗病),可通过测定一些表型数据解释QTL等位基因上存在的差异;但还有一些性状...

水产动物中的QTL QTL定位是以一定饱和度的遗传连锁图谱为基础,通过连锁分析 ,确定动物一些与经济性状相关的数量性状位点,即QTL在图谱上的位置与特定标记之间的遗传距离。对于水产养殖动物来说,标记数超过400的中高密度的遗传连锁图谱,可达到对一些数量性状进行初步定位。主要水产养殖动物品种改良的目标性状包括生长快、抗寒、抗病、耐盐碱、肉质好、高饲料转化率、发育速率快/发育时间短等。一般来说,适应性性状(如体长、体重)和抗逆性性状(如抗寒、抗病),可通过测定一些表型数据解释QTL等位基因上存在的差异;但还有一些性状,如肉质的好坏(包括肉色、肉味和松紧度)、饲料转化率的高低,由于很难对其表现性进行监测,所以进行QTL定位研究非常困难,主要水产养殖动物复杂性状的定位研究主要以前者为主。 1鲑科鱼类目前遗传连锁图谱上的标记数为1 359,分辨率达7·4 cM的虹鳟,已对抗IPN (infection pancre-atic necrosis)、抗IHN (infection hematopoietic necro-sis)、抗myxospoea、耐高温、产卵时间、胚胎早期发育、dominant albino等性状进行了定位研究(表3)。Zimmerman et al (2005)认为,鱼类的幽门盲囊是鱼类营养吸收和消化的主要组织,而且已有报道表明,幽门盲囊数增加,会显著提高虹鳟的饲料转化效率,加快虹鳟的生长。通过330个AFLP标记和39个微卫星标记对54个杂交后代进行基因分型,结果发现3个QTL位点(pcOH-3、pcOH-8、pcOH-23)与幽门盲囊数目的多少相关。另外, Nichols et al (2004)对鱼类鉴定和分类为依据的分生组织作为表型差异,对虹鳟的分生组织,如脊椎数、侧线鳞数、鳃耙等,进行了QTL定位研究。鲑科鱼类除虹鳟外,其他3种包括红点鲑(Oncorhynchusmasouishikawae)、大西洋鲑和北极嘉鱼(Salvelinusalpinus)分别对Osmotic regulation、Cryptobiosis resistance 和Upper temperature tolerance数量性状进行了QTL定位研究(表3)。2罗非鱼罗非鱼是世界上重要的养殖鱼类之一。目前其遗传连锁图谱上有550多个微卫星标记,分辨率小于3 cM,这就为一些重要的经济性状的定位研究奠定了基础(Lee et al, 2005)。研究较多的性状包括抗寒、耐盐碱以及抗病等,其中已成功将一个与抗寒性状相关的QTL位点定位到第23号连锁群上。 3沟鲶沟鲶,亦称斑点叉尾,是美国主要的淡水养殖品种,繁殖力强,种类和品系较多。目前有两种遗传连锁图谱,沟鲶和蓝鲶(Ictalurusfurcatus)的种间杂交系的遗传连锁图谱和沟鲶种内自交系的遗传连锁图谱(He et al, 2005)。种间杂交系连锁上含418个AFLP标记;种内自交系连锁图上含270个微卫星标记,以及少量的EST标记和Ⅰ型标记(表2)。利用这两种遗传连锁图谱,发现了3个标记与饲料转化率,数个标记与抗ESC病性状相连锁(He et al, 2005)。另外,我国学者孙效文和梁利群(2004)构建了鲤鱼的遗传连锁图谱,并将一个与抗寒性状相连锁的随机扩增长度多态性标记(random amplifiedpolymorphism DNAs, RAPD)定位到第5号连锁群上(表2)。日本牙鲆是一种重要的海水养殖种类,这种鱼类肉质细嫩,深受大众的喜爱。Coimbra etal (2003)公布的牙鲆遗传连锁图上共有463个微卫星标记和AFLP标记。Fuji et al(2005)将一个与抗LCD 病相连锁的分子标记定位到第15号连锁群上。发展前景由于水产养殖动物遗传连锁图谱分辨率较低(每个连锁群上定位的分子标记较少),复杂性状或数量性状的定位研究仍停留在初级水平,还不能够实现QTL精确定位。解决办法就是不断增加图谱上的标记数,提高分辨率,进一步缩小QTL在连锁群上的分布区域,实现QTL精确定位,通过分子标记辅助选择(marker-assisted selection, MAS)技术,对目标性状进行跟踪,加快优良品种的选育,提高产量。另外,通过构建BAC 库,创建BAC重叠群,获得目标性状全序列,筛选候选基因,从而实现真正意义上的基因辅助选择育种。

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