null蛋白质的生物合成
(翻译)
Protein Biosynthesis,Translation蛋白质的生物合成
(翻译)
Protein Biosynthesis,Translationnull蛋白质的生物合成,即翻译,就是将核酸中由 4 种核苷酸序列编码的遗传信息,通过遗传密码破译的方式解读为蛋白质一级结构中20种氨基酸的排列顺序 。蛋白质合成体系
Protein Biosynthesis System 蛋白质合成体系
Protein Biosynthesis System 第 一 节 参与蛋白质生物合成的物质包括参与蛋白质生物合成的物质包括20种氨基酸(AA)作为原料
酶及众多蛋白因子,如起始因子IF、延长因子EF、终止因子RF
ATP、GTP、无机离子 三种RNA
mRNA(messenger RNA, 信使RNA)
rRNA(ribosomal RNA, 核糖体RNA)
tRNA(transfer RNA, 转移RNA)一、翻译模板mRNA及遗传密码一、翻译模板mRNA及遗传密码遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为顺反子(cistron)。
原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位,转录生成的mRNA可编码几种功能相关的蛋白质,为多顺反子(polycistron) 。
真核mRNA只编码一种蛋白质,为单顺反子(single cistron) 。 null原核生物的多顺反子真核生物的单顺反子目 录null mRNA上存在遗传密码mRNA分子上从5至3方向,由AUG开始,每3个核苷酸为一组,决定肽链上某一个氨基酸或蛋白质合成的起始、终止信号,称为三联体密码(triplet coden)。起始密码( initiation coden ): AUG 终止密码( termination coden ):
UAA,UAG,UGA null 在遗传密码的破译中,美国科学家M.W.Nirenberg等人做出了重要贡献 ,并于1968年获得了诺贝尔生理医学奖.遗传密码表遗传密码表目 录1. 连续性1. 连续性遗传密码的特点 编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读,密码间既无间隔、不重叠。 一个氨基酸有几个不同的密码子的现象叫简并性。
编码同一个氨基酸的一组密码子被称为同义密码子。
意义:维持生物物种的稳定性。一个氨基酸有几个不同的密码子的现象叫简并性。
编码同一个氨基酸的一组密码子被称为同义密码子。
意义:维持生物物种的稳定性。目 录2.简并性2. 简并性(degeneracy)2. 简并性(degeneracy)目 录3. 通用性和例外3. 通用性和例外少数例外,如动物细胞的线粒体、植物细胞的叶绿体。
密码的通用性进一步证明各种生物进化自同一祖先。4.摆动性4.摆动性转运氨基酸的tRNA的反密码需要通过碱基互补与mRNA上的遗传密码反向配对结合,但反密码与密码间不严格遵守常见的碱基配对规律,称为摆动配对。 nullU摆动配对目 录IAU密码子、反密码子配对的摆动现象密码子、反密码子配对的摆动现象二、rRNA与核蛋白体二、rRNA与核蛋白体1.rRNA
与蛋白质一起构成核糖体——蛋白质合成“工厂”
存在:核糖体可游离存在,
真核中,也可同内质网结合,形成粗糙的内质网。
原核中,与mRNA形成串状——多核糖体核蛋白体的组成核蛋白体的组成目 录null原核生物翻译过程中核蛋白体结构模式:A位:氨酰基位
(aminoacyl site)P位:肽酰基位
(peptidyl site)、起始氨酰基位E位:排出位
(exit site)目 录三、tRNA与氨基酸的活化三、tRNA与氨基酸的活化反密码环氨基酸臂null
结合氨基酸:一种氨基酸有几种tRNA携带,结合需要ATP供能,氨基酸结合在tRNA3‘-CCA的位置。
反密码子:每种tRNA的反密码子,决定了所带氨基酸能准确的在mRNA上对号入座 。
tRNA与酶结合的模型 tRNA与酶结合的模型tRNA氨酰-tRNA合成酶ATPnull氨酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA都有高度特异性。
氨酰-tRNA合成酶具有校正活性(proofreading activity) 。
氨酰-tRNA的表示
方法
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:
Ala-tRNAAla
Ser-tRNASer
Met-tRNAMet null真核生物: Met-tRNAi
原核生物: fMet-tRNAf 起始肽链合成的氨酰-tRNA
(AUG-第一个氨基酸 Met ) 甲酰甲硫氨酸蛋白质生物合成过程
The Process of Protein Biosynthesis 蛋白质生物合成过程
The Process of Protein Biosynthesis 第 二 节 null氨基酸的活化
翻译的起始 (initiation)
翻译的延长 (elongation)
翻译的终止 (termination )整个翻译过程可分为翻译过程从阅读框架的5´-AUG开始,按mRNA模板三联体密码的顺序延长肽链,直至终止密码出现。 null 氨酰-tRNA合成酶
(aminoacyl-tRNA synthetase) 一、氨基酸的活化:tRNA氨基酸臂的 3'-OH 与氨基酸的羧基形成活化酯-氨基酰-tRNA。
null第一步反应氨基酸 +ATP-E —→ 氨酰-AMP-E + AMP + PPi 目 录null第二步反应氨酰-AMP-E
+
tRNA
↓
氨酰-tRNA
+
AMP
+
E目 录 二、肽链合成起始二、肽链合成起始指mRNA和起始氨基酰-tRNA分别与核蛋白体结合而形成翻译起始复合物 (translational initiation complex)。(一)原核生物翻译起始复合物形成(一)原核生物翻译起始复合物形成核蛋白体大小亚基分离;
mRNA在小亚基定位结合;
起始氨酰-tRNA的结合;
核蛋白体大亚基结合。nullIF-3IF-11. 核蛋白体大小亚基分离目 录nullIF-3IF-12. mRNA在小亚基定位结合目 录S-D序列 (mRNA上位于起始位点上游4-13个富含嘌呤的核苷酸序列)S-D序列 (mRNA上位于起始位点上游4-13个富含嘌呤的核苷酸序列)富含嘧啶起始密码子nullIF-3IF-13. 起始氨酰tRNA( fMet-tRNAimet )结合到小亚基目 录nullIF-3IF-1IF-2GTPGDPPi4. 核蛋白体大亚基结合,起始复合物形成目 录nullIF-3IF-1IF-2-GTPGDPPi目 录(二)真核生物翻译起始复合物形成(二)真核生物翻译起始复合物形成核蛋白体大小亚基分离;
起始氨酰-tRNA结合;
mRNA在核蛋白体小亚基就位;
核蛋白体大亚基结合。null真核生物翻译起始复合物形成过程三、肽链合成延长三、肽链合成延长肽链延长在核蛋白体上连续性循环式进行,又称为核糖体循环(ribosomal cycle),每次循环增加一个氨基酸,包括以下三步:
进位(entrance)
转肽(peptide bond formation)
移位(translocation)null延伸过程所需蛋白因子称为延长因子(elongation factor, EF)
原核生物:EF-T (EF-Tu, EF-Ts)
EF-G
真核生物:eEF-1 、eEF-2
指根据mRNA下一组遗传密码指导,使相应氨酰-tRNA进入核蛋白体A位。 指根据mRNA下一组遗传密码指导,使相应氨酰-tRNA进入核蛋白体A位。 (一)进位目 录null延长因子EF-T催化进位(原核生物) 目 录nullnullTuTsGTPGDPTuTsGTP目 录(二)转肽(二)转肽是由转肽酶(transpeptidase)催化的肽键形成过程。null延长过程中肽链的生成肽基转移酶(三)移位(三)移位延长因子EF-G有转位酶( translocase )活性,可结合并水解1分子GTP,促进核蛋白体向mRNA的3'侧移动 。nullfMetfMet目 录null 四、肽链合成的终止 四、肽链合成的终止当mRNA上终止密码出现后,多肽链合成停止,肽链从肽酰-tRNA中释出,mRNA、核糖体等分离,这些过程称为肽链合成终止。 null与终止相关的蛋白因子称为释放因子
(release factor, RF) 原核生物释放因子:RF-1,RF-2,RF-3
真核生物释放因子:eRF null一是识别终止密码,如RF-1特异识别UAA、UAG;而RF-2可识别UAA、UGA。
二是诱导转肽酶改变为酯酶活性,相当于催化肽酰基转移到水分子-OH上,使肽链从核蛋白体上释放。 释放因子的功能null原核肽链合成终止过程 nullRF目 录多聚核糖体 (polysome)多聚核糖体 (polysome)在细胞内一条mRNA链上结合着多个核糖体,甚至可多到几百个。目 录50S30Snull电镜下的多聚核蛋白体现象目 录null真核细胞蛋白质合成主要有以下特点:
1.核糖体更大 2.起始tRNA:起始氨基酸为甲硫氨酸。起始tRNA 为Met-tRNAiMet。 3.起始密码子为AUG,它的上游5,—端也不含富含嘌呤的序列。 4.80S起始复合物,真核细胞转译中涉及的蛋白因子更多。 5.蛋白质激酶参与真核细胞蛋白质合成的调节。
null蛋白质的合成是一个高耗能过程
AA活化 2个高能磷酸键(ATP)
肽链起始 1个(70S复合物形成,GTP)
进位 1个(GTP)
移位 1个(GTP
第一个氨基酸参入需消耗3个(活化2+起始1 )
以后每掺入一个AA需要消耗4个(活化2 +进位 1个 +移位1个)。消耗能量计算=4n-1=4(n-1)+3蛋白质合成后加工Posttranslational Processing蛋白质合成后加工Posttranslational Processing第 三 节主要包括主要包括多肽链折叠为天然的三维结构
肽链一级结构的修饰
高级结构修饰 nullN端改造 fMet的切除
信号肽(能透膜,进行蛋白质的锚定)的切除
氨基酸的修饰/改造
肽链内或肽链间的二硫键的形成、乙酰化、甲基化
氨基酸残基的修饰(Pro-OH/Cys-OH)
4.糖基化 (Asp、Ser、Thr、Asn)
5. 某些多肽要经特殊的酶切一段肽链后才有生物活性(如:胰岛素)
6. 高级结构的形成 在分子伴侣的协助下形成正确的结构