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初学VASP(七)VASP程序的编译

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初学VASP(七)VASP程序的编译 初学VASP(七) VASP程序的编译 下面以编译VASP4.4.5版本为例,编译更新的版本VASP4.5.5、VASP4.6和VASP5.0(即 将 发布)的步骤与此相同。 1、 所需文件和程序 VASP源代码:vasp.4.4.5.tar.gz和vasp.4.lib.tar.gz 数学库:LAPACK和BLAS (http://www.netlib.org/ , 或mkl(配合intel的fotran编译器用), 或ATLAS (http:/...

初学VASP(七)VASP程序的编译
初学VASP(七) VASP程序的编译 下面以编译VASP4.4.5版本为例,编译更新的版本VASP4.5.5、VASP4.6和VASP5.0(即 将 发布)的步骤与此相同。 1、 所需文件和程序 VASP源代码:vasp.4.4.5.tar.gz和vasp.4.lib.tar.gz 数学库:LAPACK和BLAS (http://www.netlib.org/ , 或mkl(配合intel的fotran编译器用), 或ATLAS (http://math-atlas.sourceforge.net/ 或Lib GOTO (http://www.cs.utexas.edu/users/flame/goto/ Fortran编译器:PGI fortran 至少 4.0以上版本(http://www.pgroup.com/ , 或Intel的 ifc (8.0以上版本是ifort, http://www.intel.com/software/products/compilers/flin/ ,前者可以从网站上下载 到 15天的试用版本,后者可以从网站下载到免费的版本。 2、下面采用PGI fortan编译器pgf90、ATLAS数学库对VASP4.4.5进行编译 这里假定已经安装好了fortran编译器,所有文件都放在/home/xxxx/VASP_SRC目录下, 机器的操作系统是Linux: Redhat9.0。 a) 从http://math-atlas.sourceforge.net/下载atlas3.6.0_Linux_P4SSE2.tar.gz, 并 用如下命令解压:tar xzvf atlas3.6.0_Linux_P4SSE2.tar.gz 解压后得到一个目录Linux_P4SSE2,在此目录下有个lib子目录,该lib子目录中的文件 为libatlas.a, libcblas.a, libf77blas.a, liblapack.a, 这些就是编译vasp时所需要 的数学库文件之一。 b) 用如下命令解压vasp.4.4.5.tar.gz和vasp.4.lib.tar.gz: tar xzvf vasp.4.4.5.tar.gz tar xzvf vasp.4.lib.tar.gz 解压后分别得到目录vasp.4.4和vasp.4.lib,目录vasp.4.4中文件是vasp的主要源代码 ,vasp.4.lib是编译vasp时需要的一些特定的数学库程序,在这两个目录中都有编译时 所用的makefile文件,针对机器和fortran编译器,选择相应的makefile。 c) 进入vasp.4.lib目录,选择makefile.linux_pg,并把它拷贝成makefile,然后键入m ake命令开始编译。整个命令如下: cd vasp.4.lib cp makefile.linux_pg makefile make 编译成功后,得到libdmy.a文件。 d) 退出vasp.4.lib目录,进入vasp.4.4目录,选择makefile.linux_pg,并把它拷贝成m akefile,编辑makefile文件,通过修改LIB变量的赋值而采用基于ATLAS的数学库文件, 修改的地方和方法是: 在第 87和 88行前加上#,把这两行注释掉,然后去掉第 91,92和 93行前的#。 修改前和后的内容为分别为: LIB = -L../vasp.4.lib -ldmy ../vasp.4.lib/linpack_double.o \ ../vasp.4.lib/lapack_double.o -L/usr/local/lib /usr/local/lib/libblas.a # # the following lines should allow you to link to atlas based blas #LIB = -L../vasp.4.lib -ldmy ../vasp.4.lib/linpack_double.o \ # ../vasp.4.lib/lapack_double.o -L/usr/local/lib \ # -L$(HOME)/archives/BLAS_OPT/ATLAS/lib/Linux_ATHLONTB/ -lf77blas –latla s #LIB = -L../vasp.4.lib -ldmy ../vasp.4.lib/linpack_double.o \ # ../vasp.4.lib/lapack_double.o -L/usr/local/lib /usr/local/lib/libblas.a # # the following lines should allow you to link to atlas based blas LIB = -L../vasp.4.lib -ldmy ../vasp.4.lib/linpack_double.o \ ../vasp.4.lib/lapack_double.o -L/usr/local/lib \ -L../Linux_P4SSE2/lib/ -lf77blas -latlas 修改后保存makefile文件,键入make命令开始编译vasp。整个命令为: cd .. cd vasp.4.4 cp makefile.linux_pg makefile 编辑修改makefile文件 make 编译成功后,就可以得到VASP的可执行文件vasp。 e) 以root帐号登录机器,把成功编译VASP后得到的vasp放到/bin目录下,则任何一个普 通用户都可以使用vasp。此时vasp可以当成于一个linux的命令来使用了,不再需要把va sp拷贝到当前的计算目录下。
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