PulseFit中文说明书

HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 1 HEKA PulseFit 中文说明书 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 2 目录 1. 介绍 2. 分析 定性数据统计分析pdf销售业绩分析模板建筑结构震害分析销售进度分析表京东商城竞争战略分析 文件 3. 第一个分析 启动PulseFit 选择一个Sweep 选择拟合类型 设置游标 拟合Sweeps 选择一个Series 显示Sweep 拟合结果 拟合Series 输出拟合 下一个Series Group拟合 退出程序 4. Sweep Fit Simplex数据拟合控件 拟合启动和停止 Simplex 拟合参数 Sweep 拟合控件 Sweep 拟合控件按钮 Sweep 拟合函数 5. Series 拟合 数据选择 Series 拟合控件 Series 拟合函数 6. Group Fit 数据选择 Group 拟合控件 Group 拟合函数 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 3 1. Introduction 2. The Analysis File 3. The First Analysis Start PulseFit................... 7 Select a Sweep ............... 7 Select Fit Type................. 7 Set Cursors ..................... 8 Fit Sweeps....................... 8 Select a Series ................ 8 Display Sweep Fit Result 8 Fit Series ......................... 9 Export Fit ......................... 9 Next Series...................... 9 Group Fit ......................... 9 Exit................................. 10 4. Sweep Fit Simplex Data Fit Control Fit Start and Terminatio 12 Simplex Fit Parameters . 12 Sweep Fit Control Sweep Fit Control Butt Sweep Fit Functions 5. Series Fit Data Selection Series Fit Control Series Fit Functions 6. Group Fit 28 Data Selection Group Fit Control Group Fit Functions HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 4 1. Introduction 通过PULSE采集的数据文件可以在PULSE程序中回放。PULSE中关于数据处理的大多数功能在 Pulsefit中都存在。Pulsefit通过更多特殊的分析功能扩充了数据处理的能力。 PulseFit和Pulse在数据文件上紧密关联。PulseFit也具有相同的数据数层次级别。分析也以结构化 的途径组织。 Sweep Fit: 原始数据曲线最低级别的分析。SweepFit对话框提供了选择曲线上某部分进行分析的 工具，并可指定要执行分析的类型(例如测量确定时间窗口内的峰值电流)。 Series Fit: 由sweep 分析得到的数值可以基于一个series进一步处理。SeriesFit对话框提供可以显 示sweepfit的结果(例如峰值电流)，作为几个可能参数(例如Relevant X-Segment的电位)的函数。现 在可以使用拟合函数来描述数据点，并产生数据拟合结果(例如IV曲线中的反转电位)。 Group Fit: Series Fit 的结果可以进一步在Group级别进行分析。GroupFit对话框允许选择SeriesFit 结果中的一个，并作为一些Series的参数(例如Series采集时的温度)。可以用拟合函数来描述这些 数据。 由于这个顺序，从数据树(Sweep, Series, or Group)中选择第一个正确的目标非常重要，然后切换 到与分析目标对应的分析对话框(Sweep Fit, Series Fit, or Group Fit,). HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 5 2. The Analysis File 对于每个要分析的数据文件，对应有一个分析文件*.ana。该文件具有和*.pul相同的结构。每个 series携带两个描述符(ascii字符串)，一个描述了分析数据在series中的级别(例如IV拟合的结果)； 另一个描述了原始数据sweeps的分析(一个完整的Hodgkin & Huxley参数集合)。Group包含了 group描述符和对应的分析。 分析参数存储在对应的树的条目中。每个条目包含一个长实数(参数)和一个枚举变量，标识参数 的状态(Fit, Hold, or Off)。 启动PulseFit，必须选择一个数据文件。如果存在匹配的*.ana分析文件，则调入。如果没有，则 创建新的分析树。注意保持*.pul和*.ana的一致性。如果对某数据文件做了一些分析，然后又在 Pulse中删除了一些sweeps，就会造成*.pul和*.ana的不一致。 所有拟合结果被输入到分析文件结构的拷贝里。在程序退出前，或者打开一个新的文件前，用户 必须决定是否更新原始的分析。程序会询问“Analysis file exists - overwrite?”。千万不要忘记回 答”Yes”，如果拟向保存你的新分析结果。 Note: 运行在 “Demo” mode的Pulsefit被限制在只能分析“Demo.dat”, HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 6 3. The First Analysis 在介绍更多细节前，我们先大概过一遍一个简单分析的几个步骤，这主要演示了如何得到一个峰 值钠电流的IV关系曲线(Demo.dat)。这部分不仔细解释特殊的拟合函数。 Start PulseFit 首先，程序会要求用户打开一个数据文件，这里我们打开“Demo.dat”。如果你以modify选项打开 数据文件，可以在PulseFit中对原始数据进行一些编 辑修改。 程序启动后，可以看到几个打开的窗体。大多数和 PULSE相同。但没有放大器窗体，却多了一个Sweep Fit window 。 Select a Sweep 你将发现和在PULSE中相同的回放窗体。点击第一个series的sweep1上，该sweep显示在示波器中。 确保示波器设置在Zero Subtract，否则你将分析未做零减的曲线。 Select Fit Type 我们想确定在指定时间区间内的电流曲线的峰值。因此我们可以使用online analysis的结果(如果Y 轴设置成Extremum)。如果我们拟合一个函数到峰值附近的曲线，然后从拟合中得到最大/最小值， 这样做会更精确。要这么做，我们必须在sweepfit窗体中选择一个拟合函数(例如多项式)，其阶 数一般小于3。 Set Cursors 我们已经选择并显示了一个sweep，该sweep包含3个段，relevant segment是第二个段。如果你点 击示波器窗体中的Cursor按钮，你将看到两根竖立的游标线，用来选择分析的时间范围。移动左 边的游标稍微向右，右边的游标稍微向左，躲开段开始和结束时的一些小的伪迹。 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 7 Fit Sweeps 第一个曲线基本上没有内向电流，因此设置游标不是那么关键。点击sweepFit窗体中的Fit按钮。 拟合曲线将叠加在数据曲线上。现在点击Next显示下一个sweep，再调整游标，得到围绕峰值电 流的平滑一些的拟合。这样处理所有的sweeps。 由于每个sweep的峰值电流的出现的时间都不同，需要经常调整游标。在其他的实验中，峰值电 流的位置不变(在Demo.dat的Series2(Hinf)中，稳态失活曲线)，就可以调整游标拟合第一个sweep， 然后点击Auto按钮自动拟合剩下的sweeps。 Select a Series 前面的分析结果已经产生了第一个Series的所有sweep的峰值电流的幅度。在回放窗体中选择 series作为新的目标。 Display Sweep Fit Results 选择了一个series为目标，你可以切换到seriesfit对话框，可以在series级别上处理sweepfit的结果： 点击SeriesFit按钮，打开SeriesFit对话框。 在该对话框中，左边有一系列的参数列 表 关于同志近三年现实表现材料材料类招标技术评分表图表与交易pdf视力表打印pdf用图表说话 pdf ，这是SweepFit的结果。我们的例子是多项式拟合，我 们对参数Ipeak感兴趣。点击Ipeak，使其高亮。现在你必须决定用来显示Ipeak的横坐标。由于我 们想画IV关系，因此选择电压作为横坐标。点击ShowData按钮，可以在右边的图形区域看到小 方块数据点了，图形是自动比例的。在图形区域的左下角，有该series的注释。 Fit Series 在可用的拟合函数类型(Type)中，我们选择Current-Voltage，会出现一些控件，这些控件可用于 描述IV关系和考虑电压依赖阻断的电压激活通道的参数。由于这个例子中，我们处理电压激活 的钠通道，我们假设有3个激活gates，我们在控件”m”中选择3(m是Hodgkin-Huxley理论中门控例 子通道的激活gates的数目的经典描述符)。我们进一步假设单通道的IV关系服从Goldman-Hod gkin-Katz 方程，所以我们从”m”右边的列表中选择GHK IV。我们不考虑任何电压依赖的阻断， 所以控件Pos. Block and Neg. Block 没有选择。 现在点击Fit按钮，程序将开始拟合。在收敛后，拟合函数将叠加在数据点上，收敛的标准在Sweep Fit window中设置。你可以按空格键手动停止拟合。新的拟合参数将更新在拟合对话框的控件中。 Export Fit 与TreeÆExport Format的设置有关，拟合对话框中Export控件将输出数据点和拟合函数。 Next Series 如果我们已经分析了多个Series的各个sweeps，我们就可以在SeriesFit对话框中用参数列表下面的 Next按钮继续处理SweepFit的结果。 Group Fit 在series级别对sweepfit的结果进行拟合得到的高一级结果，例如SeriesFit的结果，还可以进一步 分析得到更高一级(Group)结果。在Replay树中选择一个Group，点击GroupFit按钮，打开一个 GroupFit对话框，从SeriesFit结果中选择一个参数，为这个参数选择一个横坐标，显示它(show data HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 8 按钮)，选择一个拟合函数，调整拟合参数，最后做拟合。 Exit 所有拟合结果都存储在分析文件在内存的一个拷贝中。注意只要做了新的拟合，老的拟合结果就 会被覆盖。当要退出PulseFit或者调入新的分析文件，PulseFit会询问是否保存分析文件。如果有 存在的分析文件，你必须选择覆盖老的文件，或者放弃新的分析结果。 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 9 4. Sweep Fit Sweep Fit window 包含3部分： • Simplex data fit control • Sweep Fit control • Sweep Fit types Simplex 数据拟合控件函数用于为优化过程设置参数。它们 可被用在更高级别的SeriesFit/GroupFit对话框中。 Simplex Data Fit Control PulseFit中的数据拟合是根据一种Simplex 优化算法。该算法非常快，并且没有使用拟合函数的解 析衍生。缺点是没有关于优化参数的直接误差估计。为了得到理想的误差，需要从随机初始条件 开始经常重复拟合，然后评估拟合结果的统计。这不是很容易懂。因此，如果你想得到精确的拟 合结果误差估计，输出数据使用其他拟合算法，例如使用Igor中的method of steepest descent拟合 功能，该方法提供误差估计，但拟合比较慢。 Fit Start and Termination 在这3个拟合对话框 (Sweep Fit, Series Fit, and Group Fit)中，都用Fit按钮启动拟合。拟合重复的 次数和实际的残差连续更新。满足下面的条件时拟合终止： • 超过了最大的重复次数 • 满足收敛标准 • 用户发出停止操作 ( Space ,Control S or Control B , click on buttons Break or Stop). 在拟合停止后，参数显示在拟合菜单中，这些参数和一些衍生的参数存储在分析树中，以便做下 一步更高级别的分析。 下面介绍Simplex 拟合参数，初始步长大小，绝对收敛标准，最大重复次数等等。 Simplex Fit Parameters Fit Points: 该变量用于增加拟合速度。如果Fit Points小于选择时间间隔内的总点数，FitPoints 为指数分布。该特征对于开始时希望有高密度数 据点的指数衰减函数的拟合特别有用。该参数的 缺省设置是9999，如果大于实际的数据点数，所有数据点数都用于数据拟合。 Epsilon: 拟合终止标准。如果在两个连续的重复拟合中，剩余误差 (see RMS) 的变化不再超过 epsilon的范围，拟合可认为是收敛的，并可以终止。 Note: 缺省值10.0n (10-8)是一个非常严格的标准，对于很多拟合，你需要增加该数值。 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 10 Step Size: 相对的步长，用于改变第一个Simplex 重复的拟合参数。下一个步长根据Simplex算 法自动计算。如果用户想拟合结束在局部最小误差而不是全局最小误差，可以尝试增加SetpSize， 并比较其结果。如果拟合已经非常好了，而用户想做更精细拟合，SetpSize宁可小一些，以避免 发现完全不同的局部最小的风险。缺省的1%(10.0m=0.01)对大多数拟合都比较合理。 Update: 在显示和窗体更新之间的拟合重复的次数。该参数只对SweepFit操作有效。 Max. Iter.: 拟合重复的最大数目。当该次数达到时，拟合终止。 # Iterations: 重复次数计数器。在拟合过程中，该域连续更新。 RMS: 拟合和数据偏差的均方根值。RMS可作为Simplex拟合算法的残差。如果在两个连续拟合 重复中其变化小于Epsilon，拟合将终止。但是要注意，可能是局部最小的结果。 Manual Fit: 如果选择该选项，当拟合菜单中的拟合参数发生改变(鼠标拖拽或输入)，拟合函数 连续更新显示。该操作非常费时间。手动拟合只对非线性参数有效，例如指数函数的时间常数； 而线性参数象幅度，还是自动计算。 由于Simplex拟合，和其他拟合算法类似，依赖合理的启始数值， 建议 关于小区增设电动车充电建议给教师的建议PDF智慧城市建议书pdf给教师的36条建议下载税则修订调整建议表下载 在开始第一个拟合操作前 输入比较好的参数估计。可以用Show按钮来显示出猜测的参数是否够好 。用手动拟合做一些精 细调整，然后开始正式的拟合。 Note: 当拟合非线性函数时，要确保初始参数不能是0。对于指数拟合，步横设置时间常数为1(时 间常数在拟合中会转换成对数，1的对数是0)。 Sweep Fit Control 1st和2nd采集通路的原始数据曲线(sweeps)可以被拟合。 在回放窗体中选择一个sweep，设定合适的游标位置。如果你想分析不同的段，使用OnlineAnalysis 窗体提供的段偏移量函数。你也象在PULSE中一样使用示波器窗体的显示比例函数。 但需要注意，如果你改变时间轴的比例，你的游标设置可能在窗体范围之外。先大概设置游标到 目标位置，再扩展时间比例。然后再对游标做精细调整。 示波器窗体中的LeakSub按钮/ZeroSub按钮直接影响参与拟合的数据。 显示拟合结果时，原始数据以P/n的颜色作为背景。ShowP/n按钮不需要使用，实际上只要显示拟 合结果该按钮就被禁止了。拟合函数插入到其他的数据曲线显示在前景。在游标边界之外，可看 到原始数据曲线，在游标边界之内，拟合函数曲线叠加在原始数据曲线上。 Note: 改变显示比例，对拟合没有影响，只有游标的位置是关键的。 以下控件用来控制SweepFit，并可切换到高级别的分析窗体： Sweep Fit Control Buttons HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 11 Auto: 从一个Series中当前选择的sweep开始 自动拟合随后的所有sweeps。对于sweep之间 游标的边界范围维持不变的分析，该功能特别 有用。自动拟合过程中，被拟合的sweep在回 放窗体中为高亮，自动拟合过程结束后，停在 回放窗体中最后一个sweep。拟合过程中，可以用示波器窗体中的Stop按钮(Ctl+S)停止拟合。而 Break按钮(Ctl+B)可暂停拟合。 Back: 选择和显示前一个树条目。 Fit: 在给定的范围内拟合当前选择的sweep的1st/2nd曲线。(如果定位在一个Group/Series，则拟 合第一个可能的sweep)。Fit Trace 1 / Fit Trace 2 选项决定拟合哪个曲线。 Next: 选择和显示下一个树条目。 Show: 根据选择的拟合类型和参数显示拟合函数曲线。 Export: 根据输出设置(TreeÆExport Format)输出被选择的sweep和拟合结果。拟合以P/n曲线的 名义(占位)被输出。 Series Fit: 切换到Series Fit 窗体，可显示和再拟合sweeps级别分析的结果。在切换前先在回放 窗体中选择一个Series。 Group Fit: 切换到Group Fit 窗体，可显示和再拟合Series级别分析的结果。在切换前先在回放 窗体中选择一个Group。 Save Fit: 用拟合结果覆盖原始数据。该操作比较危险，因为会修改原始数据，建议只在原始数 据的副本上使用该操作。 Fit Sw. Buf.: 如果选择，将拟合sweepBuffer中的数据。请注意PulseFit可以使用任何当前选择的 目标sweep。 Notebook: 把拟合结果写入notebook。 Get Params: 从分析文件中提取被选择的sweep的拟合参数，并把这些参数作为拟合菜单中新的 初始值。GetParams按钮只在Exponentials and Hodgkin & Huxley,Gaussian等包含非线性参数的拟合 类型时出现。如果用户项恢复一个老的文件的分析，可以使用该功能。 Fit Trace 1 / Trace 2: 选择拟合哪条曲线。 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 12 Sweep Fit Functions Fit Type 决定被使用的拟合函数。(注意PulseFit 只包含非常专业的函数，专门用于分析电压依 赖通道动力学)。只要选择了一个FitType，对应的fit菜单将显示在窗体的底部。包含拟合的各个 参数，可以设置为off/hold/fit。注意一个需要被拟合的参数的初始值不能是0(对于指数函数时间 常数不能是1)，可用的拟合类型有： • Polynomial 多项式 • Exponentials 指数 • Hodgkin & Huxley • Gaussian 高斯 • Online 在线分析 • Measure 曲线测量 大多数函数都有线性和非线性参数。非线性参数用Simplex算法拟合，因此必须提供一个合理的 初始值。线性参数通过计算得到。 Polynomial: 提供了高达9阶的多项式函数，可以直接估计参数。 拟合中的极值由系数确定(类似onlineAnalysis拟合过程)。该拟合选项适合确定： 平均值(order=0)/线性衰减(order=1)/或更高阶的多项式函数。这种拟合通过拟合数据轨迹的平滑 曲线来确定峰值电流。拟合速度非常快。 Exponentials: 为了方便，由两种指数拟合，他们没有本质的区别，都可以拟合任意类型的指数数据(参数对调)。 • Exponential: 适宜拟合电流的失活时间。 • 1 - Exponential: 适宜拟合电流的激活时间。 两种拟合的主要区别是，对于exponential, amp 0 决定了指数的起点。而对于1- exponential, amp 0 决定了指数衰减或上升的终点值。指数的幅度被外推断到time0。这可以是相关段的起点/游标的 左边界/给定的时间。 tau 1-3 / amp 0-3: 有多达3个指数成分，有各自的幅度和时间常数，但公用一个起点或终点幅 度(amp0)。 time 0: 拟合的时间零点，可以是： • Segment Start: 相关段的起点。 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 13 • Cursor Position: 左游标的位置。 • Given Time 0: 指定的时间 (在相关段内部). Fit display: 该选项可指定如何显示拟合: • Fit Only: 根据边界设置画出拟合曲线。 • Full Fit: 画出整个相关段的拟合曲线。 Hodgkin & Huxley: 这是根据Hodgkin &Huxley公式，再加上任意数目的激活门(m)和失活门(h)。m和h可以指定为常 数，在拟合过程中不能改变。 时间常数τm and τh 决定激活和失活动力学特征，h∞决定稳态失活。稳态激活m∞通过期望的稳 态电流I得到。τh2 是第二失活时间常数，其相对τh的权重为a1/a2。Delay 是一个延迟时间常数。 Qon 是一个门控电荷，假设以单指数时间的衰减过程，且τg = τm。 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 14 Gaussian: 该悬想允许做最多3阶的高斯分布拟合： 参数amp, mean, sigma 对应钟形高斯分布的幅度/中点/宽度。 Online: 由onlineAnalysis确定的数值写入分析树的两个最后的条目中。通常是峰值电流和电荷。 选择该类型并点击Online或Auto按钮执行拟合。该函数用来传递onlineAnalysis结果，在线分析的 结果通常足够精确，传递到分析树里，可进一步做更高级别的分析(Series Fit, Group Fit)。 Measure: 通过measure函数确定的数值写入到分析树的最后两个条目中。选择该类型并点击 Measure按钮进入测量模式，测量结果自动保存到分析树中。 Note: 示波器窗体的 “Measure”选项不能把结果存储到分析树中。 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 15 5. Series Fit Sweep Fit 的结果存储在分析树中，有两个数组，一个是字符串描述什么类型的参数被存储，零 一个是参数的值。这些参数标识符和对应的值，作为SeriesFit的输入，在SeriesFit窗体的右边列 表中显示。 Data Selection 左边的参数列表中包含了SweepFit产生的结果参数，选择这其中参数(为纵坐标参数)，再点击 ShowData按钮，可以在图形区域显示出x相对于某个横坐标参数的小方块数据点。 如果在左边列标中选择了多个参数(Shift+鼠标点击)，则使用最后一个参数。可以使用一些拟合 函数对图形区域的数据点做拟合。 Parameter List: 参数列表顶部的左右黄箭头可遍历一个series的sweep分析结果记 录。右图的例子中，是对sweep1-17做的多项式拟合。我们选择 Ipeak参数，其数值域可以编辑。如果必要，你可以修改分析树内 的数据点。除了来自sweepfit的结果，在一个弹出菜单中还有其他 参数可以作为纵坐标，这和横坐标参数选择操作基本相同： • Off: 使用参数列表中的数据。 • Voltage: relevant X-segment 的电位。 • Duration: relevant X-segment 的宽度。 • Sweep Index: Series的索引。 • Time: 相对series开始时刻的时间。 • Real Time: sweep执行的实际时间(s) • C-slow: 慢电容补偿的数值(F) • G-series: 慢电容补偿的串联电导(S) • Rs-fraction: 串联电阻补偿深度%。 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 16 Back / Next: 这两个按钮可选择一个group中的上一个或下一个series。seriesFit对话框的标 题 快递公司问题件快递公司问题件货款处理关于圆的周长面积重点题型关于解方程组的题及答案关于南海问题 表 示当前选择的Series，例如“Series Fit_4_3”表示第4个group的第3个series。 Note: Series Fit不对何种参数被显示做任何假设。因此用户要保证提供用来做SeriesFit的参数来源 是兼容的。你可以通过表头的箭头键浏览参数 表格 关于规范使用各类表格的通知入职表格免费下载关于主播时间做一个表格详细英语字母大小写表格下载简历表格模板下载 ，检查参数标识符是否都相同。如果有sweep 没有执行分析，则对应的参数是空白且数值为0。 Export Table: 该按钮用来以ascii表格形式输出一个series的被选择的参数。例如I-peak参数，如 下表，最开始的3列总是：sweep索引/相关段电位/相关段宽度。另一列是被选择的参数。 Series No. 1 : Sweep V( 2)[mV] T( 2)[ms] I_Peak 1 -60.0 10.0 -11.231p 2 -50.0 10.0 -13.642p 3 -40.0 10.0 -36.195p 4 -30.0 10.0 -110.02p 5 -20.0 10.0 -240.97p 6 -10.0 10.0 -393.54p Abscissa: 对横坐标可选择如下参数： • Voltage: relevant X-segment 的电位。 • Duration: relevant X-segment 的宽度。 • Sweep Index: Series的索引。 • Time: 相对series开始时刻的时间。 • Real Time: sweep执行的实际时间(s) • C-slow: 慢电容补偿的数值(F) • G-series: 慢电容补偿的串联电导(S) • Rs-fraction: 串联电阻补偿深度%。 • List entry…: 参数表格(1-15)的一个条目。 Measuring with the mouse: 可以在图形区域中用鼠标点击读取X-Y值，数值在notebook中。 Series Fit Control 以下介绍用于显示与拟合操作的控件。 Show Data: 把选择的参数(纵坐标)显示成选择 的横坐标的函数。 Show Fit: 根据选择的拟合函数类型何拟合参数，显示拟合函数。 Manual Fit: 和SweepFit对话框中的手动拟合类似。任何对拟合参数的修改都会引起拟合函数显 示的更新。 Export: 输出被显示的数据和拟合。当输出Igor格式时，会和数据点以及拟合函数一起输出igor 标签描述拟合结果(e.g., Vrev = 45.5 mV)。被拟合的数据点与跳过的数据点分别在不同的waves HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 17 中，缺省时它们被显示成实心的和空心的圆点。注意，跳过的数据点的wave名称有”nf” (not fit)字样。 Skip: 跳过的点，这些点将不参与拟合。程序会询问要跳过哪些点。可以直接输入单独的点，例 如2,4,5；或者点数的范围：例如2-13；或者两种方式都用。跳过的数据点在图形中显示成星号。 重新选择Skip，则以前成星的又恢复。如果输入“none”，则所有点都恢复。Export功能会区分 参与和不参与拟合的点，以不同的wave输出。 Fit: 对活动的数据点用选择的拟合函数按Simplex算法设置(在Sweep Fit window (i.e., Max. Iterations, Epsilon, Step Size))进行拟合。 Note: 数据在拟合前必须显示出来。空格键可终止拟合。拟合结束后，拟合函数曲线会叠加在数 据点上。 Auto: 该选项将根据数据点中的极值自动调整图形比例。 Wipe: 擦除图形显示。 Get Parameters: 该选项可从上次作用于被选择数据集合的拟合中提取参数。 Get Defaults: 该选项将对存储在PulstFit程序中的给定拟合类型，提取缺省数值。这些缺省数值 对于给定的数据时灵时不灵。 Notebook: 把拟合结果写到notebook中。 Scale: 通常图形的比例是根据参与拟合的数据集 合的极值得到的。该按钮可以使用新的比例 设置。左图的对话框中包含了轴的最小/最大 值，刻度数，是否使用网格，坐标轴的位置 (左/右/零)，以及标题文本，缺省是 SeriesComment。可以指定字体和大小。 使用了Scale按钮设置新的比例后，Auto按钮 将失效，后面的拟合显示都将继续使用相同 的设置，不会根据各个series的极值自动调整 比例。如果Auto再次激活，则自动比例将对 下一个Show操作生效。 一般情况下都使用自动比例设置。使用手动比例设置可能会使数据点在图形之外而没有参与拟合 导致拟合出错。 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 18 Series Fit Functions 在这个级别，有以下可用的拟合函数： • Polynomial • Exponentials • Boltzmann • Current-Voltage • Copy Sweep 大多数拟合函数都有线性和非线性参数。非线性参数使用Simplex 算法，需要提供合理的初始值。 线性参数可以计算得到。 Polynomial: 多项式拟合，阶数为n。决定各个系数的列标输出到notebook中。对于0阶，直流电流在单独的控 件中显示。对于1阶，计算并显示过零的线性函数x(0)。对于2或3阶，极值被分析决定并显示在 对话框控件中。当2阶时，有一个峰值。当3阶时，有两个峰值。多项式的阶数，峰值数值和它们 的位置，以及多项式的系数，都写入分析文件，以便做更高级别(GroupFit)的分析。被确定的多 项式参数也写入列表控件Coefficients.。 Exponentials: 有两种类型的指数拟合，本质上是相通的，都可以用来拟合指数类型的数据。 • Exponential: 可用来拟合失活时间。 • 1 - Exponential: 可用来拟合激活时间。 两种拟合的主要区别是，对于exponential, amp 0 决定了指数的起点。而对于1- exponential, amp 0 决定了指数衰减或上升的终点值。指数的幅度被外推断到time0。这可以是相关段的起点/游标的 左边界/给定的时间。 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 19 Boltzmann: Current-Voltage: 电流-电压关系可以由各种因素组成： HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 20 Copy Sweep: 有时候，当许多series只包含一个sweep，用户想在GroupFit级别的显示Sweep分析 结果。为了这个目的，需要把一个series中给定的sweep的结果拷贝到GruopFit对话框series分析记 录中。如果拟合函数类型选择为Copy Sweep，则原来的Fit按钮会变成Copy按钮。点击这个copy 按钮拷贝结果。如果拷贝单独的sweep，则需要输入这个sweep的索引号。如果拷贝所有的sweep， 则拟合函数类型选择为Copy All Sweeps。 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 21 6. Group Fit 在seriesFit级别分析的结果可以是一个参数列表，其中一个参数可以在GroupFit级别中作为某个 横坐标的函数。利用ShowData按钮可以显示出数据点。其它控件和SeriesFit窗体非常类似。 Data Selection Parameter List: 窗体左边是参数列表。其顶部左右黄箭头可翻动一个Group中的各个sereis分析 的结果。这些分析结果可以编辑。除了来自SeriesFit的结果， 还可以选择其他参数作为纵坐标： • Off: 使用参数列表(SeriesFit结果)中的参数。 • Series Index: Group中Series的索引号。 • Time: 相对开始执行一个series的时间。 • Real Time: 执行一个series的实际时间(s)。 • V-membrane: 膜电位 (mV)。 • Temperature: 开始执行一个series的温度 (°C)。 • Bandwidth: 带宽 (Hz)。 • V-pipette: 电极电位(V)。 • V-cell: 细胞电位(对于双电极电压钳系统) (V) • Seal Resistance: 串联电阻 (Ω) • rms Background: 背景噪音 (A) • Pip. Pressure: 电极压力 (mm H2O) • User Parameter 1: 用户参数1 • User Parameter 2: 用户参数2 • Ext. Solution: 外部溶液的一个参数 • Int. Solution: 内部溶液的一个参数 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 22 Back / Next: 可以在一个root中选择不同的Group。该窗体的标题是当前选择的Group，例如 “GroupFit_3”。 Export Table: 该按钮以ascii格式格式来输出整个group中的某个参数。程序会询问“Output results of all Sweeps?”。如果回答”yes”，则输出整个Group中的SeriesFit表格。回答”no”，则只输 出一个series的参数。Shifg+鼠标点击可选择多个参数。 Abscissa: 横坐标，可选择以下参数： • Series Index: Group中Series的索引号。 • Time: 相对开始执行一个series的时间。 • Real Time: 执行一个series的实际时间(s)。 • V-membrane: 膜电位 (mV)。 • Temperature: 开始执行一个series的温度 (°C)。 • Bandwidth: 带宽 (Hz)。 • V-pipette: 电极电位(V)。 • V-cell: 细胞电位(对于双电极电压钳系统) (V) • Seal Resistance: 串联电阻 (Ω) • rms Background: 背景噪音 (A) • Pip. Pressure: 电极压力 (mm H2O) • User Parameter 1: 用户参数1 • User Parameter 2: 用户参数2 • Ext. Solution: 外部溶液的一个参数 • Int. Solution: 内部溶液的一个参数 • List Entry: 参数列表(1-15)中一个条目。 如果横坐标是Ext. Solution 或者 Int. Solution ，会显示包含可选择的溶液参数的列表。列表的各 个条目分别是Numeric, pH,Osmol, 以及单独的成分的浓度。 Measuring with the mouse: 可以在图形区域用鼠标点击读取X-Y数值。 Group Fit Control Show Data: 把选择的参数(纵坐标)显示成选择的横坐标的函数。 Show Fit: 根据选择的拟合函数类型何拟合参数，显示拟合函数。 Manual Fit: 和SweepFit对话框中的手动拟合类似。任何对拟合参数的修改都会引起拟合函数显 示的更新。 Export: 输出被显示的数据和拟合。当输出Igor格式时，会和数据点以及拟合函数一起输出igor 标签描述拟合结果(e.g., Vhalf =-62.5 mV)。被拟合的数据点与跳过的数据点分别在不同的waves 中，缺省时它们被显示成实心的和空心的圆点。注意，跳过的数据点的wave名称有”nf” (not HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 23 fit)字样。 Skip: 跳过的点，这些点将不参与拟合。程序会询问要跳过哪些点。可以直接输入单独的点，例 如2,4,5；或者点数的范围：例如2-13；或者两种方式都用。跳过的数据点在图形中显示成星号。 重新选择Skip，则以前成星的又恢复。如果输入“none”，则所有点都恢复。Export功能会区分 参与和不参与拟合的点，以不同的wave输出。 Fit: 对活动的数据点用选择的拟合函数按Simplex算法设置(在Sweep Fit window (i.e., Max. Iterations, Epsilon, Step Size))进行拟合。 Note: 数据在拟合前必须显示出来。空格键可终止拟合。拟合结束后，拟合函数曲线会叠加在数 据点上。 Auto: 该选项将根据数据点中的极值自动调整图形比例。 Wipe: 擦除图形显示。 Get Parameters: 该选项可从上次作用于被选择数据集合的拟合中提取参数。 Get Defaults: 该选项将对存储在PulstFit程序中的给定拟合类型，提取缺省数值。这些缺省数值 对于给定的数据时灵时不灵。 Notebook: 把拟合结果写到notebook中。 Scale: 通常图形的比例是根据参与拟合的数据集 合的极值得到的。该按钮可以使用新的比例 设置。左图的对话框中包含了轴的最小/最大 值，刻度数，是否使用网格，坐标轴的位置 (左/右/零)，以及标题文本，缺省是 SeriesComment。可以指定字体和大小。 使用了Scale按钮设置新的比例后，Auto按钮 将失效，后面的拟合显示都将继续使用相同 的设置，不会根据各个series的极值自动调整 比例。如果Auto再次激活，则自动比例将对 下一个Show操作生效。 一般情况下都使用自动比例设置。使用手动比例设置可能会使数据点在图形之外而没有参与拟合 导致拟合出错。 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 24 Group Fit Functions 这个级别可用的拟合函数有: • Polynomial • Exponentials • Boltzmann • Dose-Response 大多数拟合函数都有线性和非线性参数。非线性参数使用Simplex 算法，需要提供合理的初始值。 线性参数可以计算得到。 Polynomial: 多项式拟合，阶数为n。决定各个系数的列标输出到notebook中。对于0阶，直流电流在单独的控 件中显示。对于1阶，计算并显示过零的线性函数x(0)。对于2或3阶，极值被分析决定并显示在 对话框控件中。当2阶时，有一个峰值。当3阶时，有两个峰值。多项式的阶数，峰值数值和它们 的位置，以及多项式的系数，都写入分析文件，以便做更高级别(GroupFit)的分析。被确定的多 项式参数也写入列表控件Coefficients.。 Exponentials: 有两种类型的指数拟合，本质上是相通的，都可以用来拟合指数类型的数据。 • Exponential: 可用来拟合失活时间。 • 1 - Exponential: 可用来拟合激活时间。 两种拟合的主要区别是，对于exponential, amp 0 决定了指数的起点。而对于1- exponential, amp 0 决定了指数衰减或上升的终点值。指数的幅度被外推断到time0。这可以是相关段的起点/游标的 左边界/给定的时间。 HEKA PulseFit中文说明书 Ver_BC_101 HEKA GmbH@China 武汉滨川科学仪器有限公司 binliu_info@163.com 25 Boltzmann: Dose-Response: Dose-response relationship according to: