分子与细胞生物学常用词汇

分子与细胞生物学常用词汇 acetyl CoA 乙酰辅酶A 一种小分子的水溶性代谢产物,由与辅酶A 相连的乙酰基组成,产生于 丙酮酸、脂肪酸及氨基酸的氧化过程;其乙酰基在柠檬酸循环中被转移到柠檬酸。 actin 肌动蛋白,肌纤蛋白 富含于真核细胞中的结构蛋白,与许多其他蛋白相互作用。其球形单 体( G2肌动蛋白) 聚合形成肌动蛋白纤丝( F2肌动蛋白) 。在肌肉细胞收缩时F2肌动蛋白与肌 球蛋白相互作用。 activation energy 活化能 (克服障碍以) 启动化学反应所需的能量投入。降低活化能,可增加酶 的反应速率。 active site 活性中心,活性部位 酶分子上与底物结合及进行催化反应的区域。 active transport 主动转运 离子或小分子逆浓度梯度或电化学梯度的耗能跨膜运动。由ATP 耦 联水解或另一分子顺其电化学梯度的转运提供能量。 adenylyl cyclase 酰苷酸环化酶 催化由ATP 生成环化腺苷酸(cAMP) 的膜附着酶。特定配体与 细胞表面的相应受体结合引发该酶的激活并使胞内的cAMP 升高。 allele 等位基因 位于同源染色体上对应部位的基因的两种或多种可能形式之一。 allosteric transition 变构转换 小分子与蛋白质上特定调节部位相结合所引起的蛋白质之三级 及(或) 四级结构的改变,其活性随之发生变化。多亚单位酶的变构调节很普遍。 alpha(α) helix /α螺旋 常见的蛋白质二级结构,其氨基酸线性序列叠为右旋螺旋,借助主链上的 羧基与酰胺基间的氢键维持稳定。 aminoacyl2tRNA 氨酰转移核糖核酸 用于蛋白合成的氨基酸的激活形式,含有借高能酯键与 tRNA 分子上 3’2羟基相结合的氨基酸。 amphipathic 两亲的,兼性的 指既有亲水性部分又有疏水性部分的分子或结构。 anaphase ( 细胞分裂) 后期 姐妹染色体(或有丝分裂期的成对同源物) 裂开并分别(分离) 朝 纺锤体两极移动的有丝分裂期。 anticodon 反密码子 与mRNA 的密码子互补的tRNA 中三个核苷酸的序列,蛋白合成过程中,密 码子与反密码子之间的碱基配对使携带增长肽链的新增对等氨基酸的tRNA 排齐。 antiport 反向转运 协同转运的一种形式,膜蛋白(反向转运子) 向相反的方向转运两种不同的分 子或离子跨越细胞膜。 antisense RNA 反义核糖核酸 具有与某种特异性RNA 转录物或mRNA 互补序列的核糖核酸, 其结合可阻止mRNA 转录或翻译过程。 apoptosis 编程性细胞死亡, 细胞程序死亡 通过一系列很鲜明的形态学改变而导致细胞死亡的 受调节过程。 aster 星体 由微管组成的星形结构(称星状纤维) ,它在有丝分裂期自中心体呈放射状向外延伸。 ATP synthase ATP 合酶 附着在线粒体内膜、叶绿体的类囊体膜及细菌浆膜的多聚体蛋白复合 物,它在氧化磷酸化及光合作用过程中催化ATP 的合成。也叫F0F1复合体。 ATP ase ATP 酶 催化ATP 水解成ADP 与无机磷酸并释放自由能的一大族酶中的一种。 autonomously replicating sequence( ARS) 自主复制序列 可使酵母 菌DNA 分子复制的序列;酵母菌DNA 复制的一个起源。 autoradiography 放射自显影术 让照相底片或胶片暴露于样本,使样本(如组织切片或电泳凝胶) 中的放射活性分子显影的技术。片子叫作放射自显影图或放射自显影片。 auxotroph 营养缺陷体 只有培养基内含有不为野生型所需的某种特定养分或代谢物时才能够 生长的一种突变细胞或微生物。 axoneme 轴丝 存在于纤毛及鞭毛、由微管及相连蛋白构成的束, 它负责其运动功能。 basal body/ 基体 纤毛及鞭毛基底部的结构,微管自该处形成轴丝放射,构造上与中心粒相似。 basal lamina( pl . basal laminae) 基底层 细胞外基质成分组成的薄片网状物,位于大多数动物 上皮层及其他形成组织的细胞(如肌肉) 的结构之下,使其与结缔组织分隔开来。 base/ 碱基 通常含有氮,可以接受一个质子(H+ ) 的化合物。一般在DNA 和RNA 中表示嘌呤 与嘧啶。 base pair/ 碱基对 DNA 或RNA 分子上两个互补核苷酸的结合,靠彼此碱基成分间的氢键来固 定。 beta(β) sheet/β- 折叠 蛋白质的平面二级结构,由两个不同多肽链或一个折叠链片段上的主链 原子间的氢键形成。 cadherin/ 钙粘着蛋白 Ca2 + 依赖性细胞粘附分子家族中的蛋白,在组织分化及构造中发挥作 用。 Calvin cycle/ 卡尔文循环,光合碳还原环 在光合作用过程中,将二氧化碳固定于碳水化合物的 主要代谢途径,又称碳的固定。该循环间接依赖于光线,不过黑暗及光亮时均可发生。 cAMP- dependent protein kinase( cAPK) 环腺苷酸依赖蛋白激酶 一种胞质酶,由环腺苷酸来激 活,具有调节众多细胞蛋白的作用;也叫作蛋白激酶A。一般而言,其激活是对G蛋白偶联受体刺激 引起的环腺苷酸水平升高而作出的反应。 capsid/ 衣壳 病毒的蛋白质外壳,由一个或多个蛋白亚单位复制而成,围绕着病毒核酸。 cDNA( complementary DNA) 互补DNA mRNA 分子的DNA 拷 贝,由反向转录酶而来,故缺乏基因组DNA 上的内含子。由cDNA 序列可推断编码蛋白的氨基酸序 列;DNA 在重组细胞的表达可用于其编码蛋白在体外的大量生成。 cell cycle/ 细胞周期 细胞复制其染色体并一分为二的有序的一系列事件。大多真核生物周期可 被分为四个时期: G1期(DNA 合成前) ; S 期(DNA 复制) ; G2期(DNA 合成后) ;M期(细胞分裂 成两个子细胞) 。 cell division/ 细胞分裂 一个细胞分裂成为两个子细胞。在较高级的真核生物,这包括细胞核的 分裂(有丝分裂) 以及胞质的分裂(胞质分裂) ;常用有丝分裂来指代核及胞质的分裂。 cell fusion/ 细胞融合 利用多种技术刺激两个细胞在接触部位发生质膜融合,而生成包含两个或 更多细胞核,胞质彼此混合的杂交细胞。 cell junction/ 细胞连接 细胞表面的特化区域,细胞借此与其他细胞或细胞外基质相接。 cell line/ 细胞系 植物或动物起源的培养细胞群,经过某种变化使细胞可以无限制生长,与细胞 株不同。细胞系可由化学或病毒转化而来,据称可以永生。 cell strain/ 细胞株 植物或动物起源的细胞群,生命周期有限,与细胞系不同。 cell - adhesion molecules( CAMs) 细胞粘附分子 介导细胞间结合的膜整合蛋白,主要有五类:整 合素,钙粘着蛋白,选择蛋白,免疫球蛋白超家族及粘蛋白。 centromere/ 着丝粒 有丝分裂染色体的缩窄处,姐妹染色体在此相接,动粒纤维由此出发向纺锤 体顶端延伸;为有丝分裂和减数分裂时染色体正确分离所需。 centrosome( cell center) 中心体( 细胞中心) 动物细胞中位于核附近的细胞器,是原始的微管 组织中心(MTOC) ,包含一对中心粒。有丝分裂期间分裂,形成纺锤体的两极。 chaperone/ 蛋白伴侣,分子伴侣 分子伴侣和伴侣蛋白两类蛋白的总称,前者防止目标蛋白错折 叠,后者则促进其正确折叠。 checkpoint/ 关卡 真核细胞周期中的数个时间点,细胞向下一个阶段的进程会在此暂停至条件 适宜时再前进。 chemiosmosis/ 化学渗透 借助跨膜电化学质子梯度(pH 及电位)来驱动像ATP 合成或分子逆 浓度梯度跨膜等耗能过程,又称为化学渗透偶联。 chimera/ 嵌合体 由来自不同遗传个体元件构成的动物或组织;也指片段来自不同蛋白的蛋白 分子。 chromatography ,liquid/ 液体层析( 液体色谱法) 根据质量(凝胶过滤层析) 、电荷(离子交换 层析) 、或与其他分子特异结合的能力(亲和力层析) ,将多分子混合液进行分离的一组生物化学 技术。 cis -acting/ 顺式作用指DNA 上的调节序列(如强化子,促进子) ,它只可能控制同一染色体上的基 因。在细菌,顺式作用元件与其控制的基因相邻或居其近端,而在真核生物则可相距较远。 cistron/ 顺反子 编码单个多肽的基因单位。 clathrin/ 包涵素 一种纤维状蛋白,在装配蛋白的协助下,在细胞膜内侧面特定区域聚合成网格 结构,并形成网格蛋白覆盖的凹陷,脱落形成囊泡。 clone/ 克隆 由单一亲代产生的完全相同的一组细胞或DNA 分子,也指由单一亲代而来的遗传 学上完全相同的病毒或生物。 cloning vector/ 克隆载体 为了基因克隆而用于携带DNA 或DNA片段进入宿主细胞的自动自我 复制的遗传成分。常用的载体是细菌质粒与修饰过的噬菌体基因组。 codon/ 密码子 DNA 或mRNA 上三个核苷酸的序列,蛋白合成时利用它来确定特定的氨基酸。 也叫作三联体。在 64 种可能密码子中,3 个是终止密码子,不用来决定氨基酸。 coiled2coil/ 卷曲螺旋 稳定的杆状四级蛋白结构,由两个或三个沿着其长度相互作用的α螺旋 形成。通常见于纤维样蛋白及某些转录因子。 complementary/ 互补的 指彼此间能够构成完美碱基配对的双螺旋的两个核酸序列或链;也指 两个相互作用的分子(如酶与其底物) 上如锁与匙般相配的区域。 complementation/ 互补作用 在遗传学上,指单倍体衍生的二倍体杂合子之野生型功能(如在半 乳糖上生长) 的恢复,每个单倍体携带有突变体,而该突变体又各位于编码同一生化通路所必需蛋 白的不同基因上。 conformation/ 构象 由分子中原子的空间位置所决定的蛋白质或其他大分子的精确的三维形 状。在某些蛋白,构象的轻微变化便严重影响其活力。 consensus sequence/ 共有序列 相关DAN , RNA 或蛋白序列的每个位置最常见的核苷酸或氨 基酸。 constitutive mutant/ 结构型突变 (1) 一种以恒定水平合成蛋白的突变体,其情况如同受到持续 诱导一样; (2) 在没有诱导物的情况下操纵子被转录的一种调节性细菌突变; (3) 被调控酶处于 持续活性形式的一种突变。 cooperativity/ 协同性 某些蛋白质具有多个配体结合部位,一个配体分子的结合使后继配体分 子的结合亲和力增强(正向协同) 或减弱(负向协同) ,这些蛋白所表现出的这种特性称为协同性。 cosmid/ 黏粒 用于克隆大DNA 片段的一类载体。 crossing over/ 交换 减数分裂期间母体染色体与父体染色体之间遗传物质的交换,形成重组染 色体。 cyclin/ 周期蛋白 浓度随真核细胞周期进程而升降的几种相关蛋白中的任一种,它与周期蛋白 依赖激酶构成复合体,从而激活并确定这些酶的底物特异性。 cyclin2dependent kinase( Cdk) 周期蛋白依赖激酶 只有与周期蛋白结合才具有催化活性的一 种蛋白激酶。不同的Cdk2 周期蛋白复合体通过使特异靶蛋白磷酸化而启动真核细胞周期进程的 不同阶段。 degenerate/ 简并的 就遗传密码而言,指多个密码子均可确定一个特异氨基酸。 determination/ 确定 胚胎发育中,使细胞朝向特定发育路径的细胞内变化。 differentiation/ 分化 由于基因表达的变化而致使前体细胞变为各种特化细胞类型的过程。 DNA cloning/ 克隆DNA 重组DNA 技术,也称为基因克隆。它是将DNA 或基因组的DNA 片段嵌 入克隆载体,再将载体植入培养的宿主细胞(如E. coli 细胞) ,并在宿主细胞生长期间得到维持。 DNA library/ DNA 库 插入适当载体的所有mRNA 的DNA 拷贝产生的(c DNA 库) 克隆DNA 分子的集合,这些分子可能是整个基因组(基因组库) 的片段,或者是一种细胞类型。 DNA polymerase/ DNA聚合酶 复制一条DNA 链(模板链) 来形成用以构成新双链DNA 分子互 补链的酶。所有DNA 聚合酶每次仅增加一个脱氧核糖核酸分子。 domain/ 域 具有独立三级结构(如球形或杆状) 与特征性活性的蛋白区域。同源域会出现在不 同的蛋白中。 dominant/ 显性的,优势的 遗传学上,指等位基因中能在杂合子表型表达的基因;未表达的等位 基因被称为隐性的。也指与显性等位基因关联的表型。 downstream/ 下游 对基因而言,指转录期间RNA 聚合酶移动的方向,也就是朝向含一个 3’羟 基模板DNA 链的末端。按惯例,基因上的+ 1 位是首先被转录的核苷酸; + 1 位下游的核苷酸被 依次命名为+ 2 , + 3 等。此外,也指在一连串步骤中 后发生的事件。 dynein/ 动力蛋白 ATP 供能的运动蛋白家族的成员,与微管蛋白形成联结、分裂、再形成新联 结,周而复始,从而向微管( - ) 终端运动。它能够运输囊泡,负责纤毛及鞭毛的运动。 elongation factor/ 延伸因子 一组非核糖体蛋白中的一种,为翻译起 始以后mRNA 的连续被翻译所需。 endosome ,late/ 后核内体 内部pH 为酸性的分捡小泡,已结合的配 体在此与它们的膜结合受体蛋白解离。后核内体参与溶酶体酶类的分类及质膜内吞受体的再循 环。 enhancer/ 增强子 真核生物DNA(极少见于原核生物DNA) 上的调节性序列,其位置可距它所控 制的基因相当远。特异蛋白与增强子的结合调节着相关基因转录的速度。 entropy( S) 熵 对一个系统中不规律性或随机性程度的一种度量;熵越高,越不规律。 epitope/ 抗原决定部位, 表位 抗原分子上与抗体结合的部分,也叫 做抗原决定簇。 exon/ 外显子 真核生物基因(或其初级转录物) 的片段,作为成熟 mRNA ,rRNA 或tRNA 分子的一部分而被运送到胞质。 exoplasmic face/ 外质膜面 细胞膜背离胞质的那一面。质膜的外质 膜面朝向细胞外,而细胞器(如线粒体、叶绿体、内质网) 的外质膜面则朝向它们的腔。 expression cloning/ 表达克隆 根据编码蛋白的功能特性分离cDNA 或基因组DNA 节段的重组DNA 技术,无须事先纯化蛋白。也指当蛋白的c DNA 或基因被克隆后, 获得高水平全长蛋白的技术。 expression vector/ 表达载体 携带基因或c DNA 进入恰当的宿主细 胞,并引导编码蛋白合成的经修饰的质粒或病毒。有些表达载体被 设计 领导形象设计圆作业设计ao工艺污水处理厂设计附属工程施工组织设计清扫机器人结构设计 用来探测DNA 库,寻找某 个特定基因;另外,也可用经由克隆基因生产大量蛋白。 f ibronectin/ 纤连蛋白 一种细胞外多黏蛋白,与其他整联蛋白家族的成员如基质成分、纤维蛋 白及细胞表面受体相结合。其作用是将细胞与胞外基质相连接,在伤口愈合中颇为重要。 footprinting/ 足迹法 用来鉴定DNA 或RNA 的蛋白结合部位的一种技术。用核酸酶来消化放射 标记的有或没有特定结合蛋白的核酸样本,由于DNA 或RNA 带结合蛋白的部位受到保护不被消 化,而受保护与不受保护样本所分离出的凝胶电泳片段带谱不同,可以此来鉴定蛋白结合部位。 free energy( G) 自由能 对一个系统潜在能量的度量,是焓( H) 和 熵( S) 的函数。 free - energy change( ΔG) 自由能变化 化学反应中,产物分子与 起始分子(反应物) 的自由能之间的差别。自由能负值很大时,说明化学反应发生的趋势很强,也就 是说,在达到化学平衡时,产物的浓度将远远大于反应物的浓度。 Gprotein/ G蛋白 作用于细胞内信号转导路径的为数众多的异三聚体GTP - 结合蛋白中的任何 一种;通常被配体与跨膜七次偶联的细胞表面受体结合所激活。 Gprotein2coupled receptor( GPCR) G蛋白偶联受体 一类重要的细胞表面受体成员,有七个跨膜 α螺旋,直接与三聚体G 蛋白偶联。 gene/ 基因 遗传的生理及功能单位,将上一代的信息携带到下一代。从分子的角度讲,是指生产 功能蛋白或RNA 所需的全部DNA 序列,包括外显子、内含子及非编码转录控制区。参见顺反子 (cistron) 及转录单位。 gene cloning/ 基因克隆 见DNA 克隆。 gene control/ 基因控制 所有调节基因表达所涉及的机制。最常见的是转录的调节,影响mRNA 加工、稳定及翻译的机制也有助于某些基因的控制表达。 gene conversion/ 基因转换 在减数重组过程中,基因的一个等位基因被转换成另一个的现象。 gene expression/ 基因表达 一个基因包含的编码信息被转换成可观察到的表型(最常见是蛋白 产物) 的整个过程。 genetic code/ 遗传密码 DNA 或RNA 上核苷酸三联体(密码子) 确 定蛋白的氨基酸所遵循的一系列规则。 genome/ 基因组 一个细胞或生物所携带的全部遗传学信息。 genomic DNA/ 基因组DNA 组成一个细胞或生物基因组的全部 DNA 序列。 genomics/ 基因组学 对不同生物的整个基因组序列的比较分析,用以确定种属间的进化关系, 预测分析某一生物生成蛋白的数目及基本种类。 genotype/ 基因型 某个体细胞或生物体的全部基因结构,也指一个或多个基因座上的等位基 因。 germ cell/ 生殖细胞 能产生配子的任何前体细胞。 germ line/ 种系 生殖细胞的谱系,产生配子而参与下一代生物体 的构成;同时,通过配子向下一代输送遗传物质。 growing fork/ 生长叉 双链DNA 上模板链分离、脱氧核糖核酸增 加到每一新形成链发生的位置,也叫复制叉。 GTPase superfamily/ 鸟苷三磷酸酶超家族 一组GTP 结合蛋白,在GTP 结合失活状态与GTP 结合活性状态间循环。包括G蛋白,Ras 蛋白,还有某些多肽的延长因子,是细胞内的开关蛋白。 Hela cell/ 海拉细胞 人类上皮细胞株,从人类宫颈癌衍生而来,此株极易培养生长,被广泛用于科 学研究。 helicase/ 解旋酶 沿着DNA 双螺旋移动,借助ATP 水解释放的能量将两条链分离(解旋) 。为 DNA 复制和转录所需。 helix2loop2helix/ 螺旋 2环 2螺旋 见于许多单体Ca2 + 结合蛋白及二 聚体真核转录因子的一种保守结构基序。 helix2turn2helix/ 螺旋 2转角 2螺旋 见于大多数细菌DNA 结合蛋白 中的一种DNA 结合基序。 Holliday structure/ 霍利迪结构 重组过程中介于同源染色体间的 中间结构。 homeobox/ 同源异型框 在某类由特定同源异型基因编码的转录因 子中编码一个DNA 结合域(同源域