nullnull 第二章
酶的结构和功能第一节 酶的化学组成
第二节 酶分子的结构
第三节 酶的分子结构与功能
第四节 酶的活性中心null第一节 酶的化学组成
一,酶分子组成
酶的化学本质绝大多数是蛋白质*,所以人们
根据酶分子的组成将他们划分为:
单纯酶∶分子组成全为蛋白质。
结合酶∶分子组成中除蛋白质外,还有非
蛋白质部分。
null对结合酶来说:
全酶 = 酶蛋白 + 辅助因子
金属离子
辅助因子(cofactors)
小分子有机化合物
辅助因子本身无催化作用,但一般在酶促反应中
起运输转移电子、原子或某些功能基团的作用。辅基(prosthetic group)——与酶蛋白结
合紧密
辅酶(coenzyme)——与酶蛋白结合松弛,用
透析法可以分开小分子有机化合物 对双成份酶(结合蛋白质)来说,辅助因子与酶蛋白应是1∶1,缺失就
表
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现不出活性,缺少就会影响活性,但超比例也不会提高活性。null 生物体内酶的种类极多,但辅助因子种类很有限。同一种辅助因子往往能与多种不同的酶结合,形成不同的全酶,如氧化还原酶类一般都以NAD(P)、FMN、FAD为辅助因子。而某种特定的酶一般只与一种辅酶结合。故酶蛋白决定酶的专一性,而辅助因子与酶的活性有关。维生素是辅酶的主要组成部分null
二,酶蛋白分子的组成
单体酶
寡聚酶
多酶复合体
null
1、单体酶(monomeric enzyme )
催化水解反应的一般都是单体酶。
它是一个具有完整生物功能、独立三级结构的蛋酶蛋白部分只有一条多肽链的酶称为单体酶。分子量在13000~35000之间。
如∶溶菌酶、胰蛋白酶。2、寡聚酶(oligomeric enzyme )2、寡聚酶(oligomeric enzyme ) 由两个或两个以上亚基组成的酶称为寡聚酶。
它以四级结构作为完整生物功能分子结构形式。
亚基可以是相同的,也可以是不同的。亚基之间
不是共价结合,彼此之间很容易分开,分开后酶
活性就会丧失。
分子量较大,从35000到几百万。
与单体酶相比,寡聚酶具有变构作用,与调节因子结合后,能发生构象变化,导致催化活性的变化,从而对代谢起调节作用。
null3、多酶体系(multienzyme system)
由若干酶相互连接形成的反应链体系称为多酶体系,而具体的化学反应过程称为代谢途径。如糖酵解途径中的10种酶构成了一个多酶体系。nullnull 4, 多酶复合体
由几种酶彼此嵌合形成一个功能完整的具有特定结构的复合体,称为多酶复合体。它有利于一系列反应的连续进行,大大提高催化效率,同时有利于进行调控。
如:脂肪酸合成酶复合体、丙酮酸脱氢酶复合体
这类多酶复合体分子量很高,一般在几百万以上。四级结构对于多酶复合体很重要,一旦复合体解体,各个酶单独无法实现催化。 第二节 酶分子的结构第二节 酶分子的结构 酶催化的高效率、高度专一性和酶活
性可调节性都与酶蛋白本身的结构直接相
关。酶蛋白的一级结构决定其空间结构,
而酶的空间构象是酶催化功能的结构基础一 酶的活性部位
二 酶的别构部位
三 酶原和酶原激活
四 同工酶nullnullnullnullnullnullnull肽链内形成氢键,氢键的取向几乎与轴平行,每个氨基酸残基的C=O氧与其后第四个氨基酸残基的N-H氢形成氢键。
绝大多数天然蛋白质中的-螺旋几乎都是右手螺旋。
-螺旋都是由L-型氨基酸构成的(Gly除外)。1 -螺旋
-螺旋及结构特点(二) 二级结构的种类nullnullnullnullNNN平行式nullNCN反平行式nullnull4 无规卷曲或自由回转 肽段在空间的不规则排布称为无规则卷曲。
在一般球蛋白分子中,往往含有大量的无规则卷曲,它使蛋白质肽链从整体上形成球状构象。 null无规则卷曲示意图细胞色素C的三级结构无规则卷曲null5 超二级结构超二级结构指蛋白质中相邻的二级结构单位(-螺旋或-折叠或-转角)组合在一起,形成有规则的、在空间上能够辨认的二级结构组合体。
nullnullnull
null超二级结构类型 X nullnull结构域1结构域2-折叠-转角二硫键-螺旋nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull一、酶一级结构与功能的关系
(一)酶一级结构决定酶的功能
(二)同功酶一级结构的种属差异性
(1)亲缘关系越近,AA顺序的同源性越大。
(2)尽管不同生物间亲缘关系差别很大,但与功能密切相关的AA顺序却有共同之处,即保守顺序不变第三节 酶的分子结构与功能null牛核糖核酸酶(一)酶的活性表现需要酶维持一定的空间构象null(二)有些酶分子在表现其生物功能时,构象必须发生一定的变化.null酶的必需基团(essential group):
与酶活性有关的基团
酶的活性中心(active center):
由必需基团构成的与酶催化活性有关的特定区域.
第四节 酶的活性中心(active site)一、活性中心的概念null酶分子非必需基团必需基团活性中心
必需基团活性中心外
必需基团结合基团催化基团非活性中心活性中心null活性中心的重要化学基团
7种氨基酸出现的频率最高
Lys Asp Glu Cys His Tyr Ser
(兰天果拌猪肉丝)
某些功能基团,如(氨基、羧基、巯基、羟基
和咪唑基)是酶的必需基团。
赖氨酸的氨基
天冬氨酸和谷氨酸的羧基
半胱氨酸的巯基
组氨酸的咪唑基
酪氨酸和丝氨酸的羟基nullnullnull二、活性中心的共性(1)活性部位只占酶分子很小的一部分(1-2%)。
(2)活性部位是一个三维实体。
(3)活性中心位于酶分子表面的疏水性裂缝中。
(4)活性中心构象不是固定不变的(诱导契合)。
(5)酶与底物通过盐键、氢键、范德华力和疏水作用等次级键结合。nullnullnull三、研究酶活性中心的方法1. 物理学方法:
用X射线衍射法直接检测底物或其类似物与酶形
成的中间复合物(包括酶和底物)的相对位置。
2. 化学修饰法
1)非专一性化学修饰
2)专一性化学修饰
3)亲和标记null1. 物理学方法:
用X射线衍射法直接检测底物或其类似物与酶形成的中间复合物(包括酶和底物)的相对位置。研究酶活性中心的方法null2.化学修饰法:根据所用修饰试剂不同,分为
1)非专一性化学修饰
用非专一性的修饰试剂与氨基酸侧链基团作用。
若某基团被修饰后:
酶活性不变——该基团可能不是酶的必需基团
酶活性降低或丧失——该基团可能是酶的必需基团
但不能确定化学试剂是同活性中心内的必需基团结合。null活性中心基团的鉴定
标准
excel标准偏差excel标准偏差函数exl标准差函数国标检验抽样标准表免费下载红头文件格式标准下载
①失活程度与修饰剂浓度成一定比例关系。
②S或可逆抑制剂有保护作用(活性中心)。
先加S或竞Ⅰ 加共价修饰剂 透析除去S或竞Ⅰ 活性不丧失null 差别标记:
底物或抑制剂存在 活性基团不与修饰剂作用
去除底物或抑制剂 原来被保护的基团带同位素标记
可直接得到蛋白质发挥功能作用的必需基团。化学修饰含同位素标记 的同样试剂null2)专一性化学修饰(基团专一性修饰)
用专一性化学修饰剂修饰酶活性中心的某一氨基酸残基的侧链基团。
3)亲和标记(位点专一性修饰)
采用的修饰试剂是根据底物的化学结构
设计
领导形象设计圆作业设计ao工艺污水处理厂设计附属工程施工组织设计清扫机器人结构设计
合成的含有活泼反应基团的底物类似物。
作用机制:利用酶对底物的特殊亲和力将酶加以修饰标记。null化学修饰的专一性nullYYYX-YXnull亲和修饰剂:
①与S结构相似,与活性中心的氨基酸残基
亲和力大,而与活性中心以外的氨基酸
残基亲和力小。
②具有活泼的化学基团(如卤素)可与活性
中心的基团形成稳定的共价键。本章要点本章要点酶分子组成:单纯酶、结合酶(辅助因子)
酶蛋白组合方式:单体、寡居、多酶复合
各级结构的概念,二级结构种类及特点
结构域的概念与特征
结构与功能关系,活性中心组成及功能基团
研究酶蛋白结构与活性中心的方法